Predikce transpozonů v DNA
| but.committee | prof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda) prof. Ing. Tomáš Vojnar, Ph.D. (místopředseda) Ing. Vladimír Bartík, Ph.D. (člen) doc. Ing. Jan Janoušek, Ph.D. (člen) doc. Ing. Tomáš Martínek, Ph.D. (člen) doc. Ing. František Zbořil, CSc. (člen) | cs |
| but.defence | Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm velmi dobře (B). Otázky u obhajoby: Aká bola presnosť Vašej implementácie na generovaných dátach (sekcia 7.1)? | cs |
| but.jazyk | angličtina (English) | |
| but.program | Informační technologie | cs |
| but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
| dc.contributor.advisor | Martínek, Tomáš | en |
| dc.contributor.author | Černohub, Jan | en |
| dc.contributor.referee | Vogel, Ivan | en |
| dc.date.created | 2014 | cs |
| dc.description.abstract | Cílem práce je seznámení se s problematikou uchovávání informace v DNA, provést rešerši na téma transpozony, bioinformatické nástroje a algoritmy, které jsou používány k jejich detekci v nasekvenovaných genomech a vytvořit tak stručný úvod do obsáhle problematiky, včetně jejího zasazení do kontextu současně probíhajícího výzkumu v dané oblasti. Na základě přehledu stávajících algoritmů a nástrojů pro detekci transpozonů je navržen a implementován nástroj pro hledání tzv. LTR transpozonů. | en |
| dc.description.abstract | The paper offers brief introduction into DNA with focus on transposable elements also know as transposons and how do they relate to the ongoing research into biology - seen mainly from the bioinformatics point of view. The goal is to research past and concurrent tools and algorithms that were developed for transposon detection in sequenced genomes. Based on the surveyed designs a proposal for long terminal repeat transposons oriented tool is created and implemented. | cs |
| dc.description.mark | B | cs |
| dc.identifier.citation | ČERNOHUB, J. Predikce transpozonů v DNA [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2014. | cs |
| dc.identifier.other | 79735 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/53273 | |
| dc.language.iso | en | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | bioinformatika | en |
| dc.subject | DNA | en |
| dc.subject | transpozon | en |
| dc.subject | evoluce | en |
| dc.subject | retroviry | en |
| dc.subject | detekce | en |
| dc.subject | predikce | en |
| dc.subject | LTR | en |
| dc.subject | pole suffixů | en |
| dc.subject | bioinformatics | cs |
| dc.subject | DNA | cs |
| dc.subject | transposable elements | cs |
| dc.subject | transposon | cs |
| dc.subject | evolution | cs |
| dc.subject | retro-viruses | cs |
| dc.subject | detection | cs |
| dc.subject | prediction | cs |
| dc.subject | LTR | cs |
| dc.subject | long terminal repeats | cs |
| dc.subject | suffix array | cs |
| dc.title | Predikce transpozonů v DNA | en |
| dc.title.alternative | Prediction of Transposons in DNA | cs |
| dc.type | Text | cs |
| dc.type.driver | masterThesis | en |
| dc.type.evskp | diplomová práce | cs |
| dcterms.dateAccepted | 2014-06-24 | cs |
| dcterms.modified | 2020-05-10-16:11:32 | cs |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta informačních technologií | cs |
| sync.item.dbid | 79735 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2025.03.26 15:17:09 | en |
| sync.item.modts | 2025.01.17 13:09:39 | en |
| thesis.discipline | Bioinformatika a biocomputing | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav počítačových systémů | cs |
| thesis.level | Inženýrský | cs |
| thesis.name | Ing. | cs |