but.committee	prof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda) prof. Ing. Miroslav Švéda, CSc. (místopředseda) Ing. Jaroslav Dytrych, Ph.D. (člen) Ing. Martin Hrubý, Ph.D. (člen) doc. Ing. Jan Kořenek, Ph.D. (člen)	cs
but.defence	Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm D. Otázky u obhajoby: V závěru práce naznačujete, že pro dosažení větší přesnosti prediktoru může vést upravení datové sady nebo zavedení nových příznaků. Jaké konkrétní úpravy datové sady nebo nové příznaky by to mohly být?	cs
but.jazyk	čeština (Czech)
but.program	Informační technologie	cs
but.result	práce byla úspěšně obhájena	cs
dc.contributor.advisor	Martínek, Tomáš	cs
dc.contributor.author	Čermák, Jiří	cs
dc.contributor.referee	Hon, Jiří	cs
dc.date.created	2017	cs
dc.description.abstract	Abychom dosáhli levnější a efektivnější výroby proteinů, musíme být schopni predikovat, zda budou proteiny rozpustné. V této práci se zabýváme vytvořením bioinformatických datových sad na základě databází Target Track a eSol, testováním příznaků používaných v existujících nástrojích zabývajících se rozpustností proteinů a tvorbou nového prediktoru. Přestože se nám nedaří vytvořit efektivní nástroj na predikci rozpustnosti proteinů, zjišťujeme, že ve většině případů staré příznaky na nové datové sadě nekorelují s rozpustností proteinů tak silně, jako tomu je u starších a menších datových sad.	cs
dc.description.abstract	To achieve cheaper and more efficient protein production, we must be able to predict protein solubility. In this thesis, we describe creation of bioinformatic data sets based on Target Track and eSol databases, we test the features used in existing protein solubility prediction tools and create a new predictor. Even though we fail to create an effective prediction tool we find out that in most cases the old features tested on the new data do not correlate with protein solubility as strongly as others repot in older and smaller datasets.	en
dc.description.mark	D	cs
dc.identifier.citation	ČERMÁK, J. Bioinformatický nástroj pro predikci rozpustnosti proteinů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2017.	cs
dc.identifier.other	106439	cs
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11012/69679
dc.language.iso	cs	cs
dc.publisher	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií	cs
dc.rights	Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení	cs
dc.subject	Rozpustnost proteinů	cs
dc.subject	Strojové učení	cs
dc.subject	Agregace proteinů	cs
dc.subject	Proteinové inženýrství	cs
dc.subject	Syntéza proteinů	cs
dc.subject	Protein solubility	en
dc.subject	Machine learning	en
dc.subject	Protein Aggregation	en
dc.subject	Protein engineering	en
dc.subject	Protein synthesis	en
dc.title	Bioinformatický nástroj pro predikci rozpustnosti proteinů	cs
dc.title.alternative	Bioinformatics Tool for Prediction of Protein Solubility	en
dc.type	Text	cs
dc.type.driver	bachelorThesis	en
dc.type.evskp	bakalářská práce	cs
dcterms.dateAccepted	2017-06-14	cs
dcterms.modified	2020-05-10-16:13:06	cs
eprints.affiliatedInstitution.faculty	Fakulta informačních technologií	cs
sync.item.dbid	106439	en
sync.item.dbtype	ZP	en
sync.item.insts	2025.03.18 19:00:06	en
sync.item.modts	2025.01.15 16:21:10	en
thesis.discipline	Informační technologie	cs
thesis.grantor	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav počítačových systémů	cs
thesis.level	Bakalářský	cs
thesis.name	Bc.	cs

Bioinformatický nástroj pro predikci rozpustnosti proteinů

Files

Original bundle

Collections