Vyhledávání kódujících úseků pomocí analýzy DNA spektrogramu

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Valentýna Provazník, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Milan Chmelař, CSc. (místopředseda) Ing. Pavel Leinveber (člen) prof. MUDr. Marie Nováková, Ph.D. (člen) doc. RNDr. Michal Masařík, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Studentka obhájila bakalářskou práci a odpověděla na otázky členů komise.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorKubicová, Vladimíracs
dc.contributor.authorSpíchalová, Barboracs
dc.contributor.refereeProvazník, Valentýnacs
dc.date.created2013cs
dc.description.abstractTato bakalářská práce se zabývá vyhledáváním kódujících úseků pomocí analýzy DNA spektrogramu. V teoretické části jsou popsány numerické reprezentace genomických dat, možnosti úprav sekvencí DNA a charakteristika metod pro vyhledávání kódujících úseků. Nejpoužívanější metodou pro zpracování DNA je diskrétní Fourierova transformace, díky které jsme schopni v sekvenci vyhledávat požadované úseky. Dále je uveden teoretický postup pro vytvoření spektrogramu a výčet vzorů z něj detekovatelných. Nabyté teoretické znalosti nám slouží k praktické realizaci konkrétních metod v programovém prostředí MATLAB. Vytvořili jsme program pro detekci kódujících úseků ze spektrogramu a nalezení jejich přesných pozic v sekvenci. Námi dosažené výsledky jsou v závěru porovnány s databází NCBI.cs
dc.description.abstractThe Bachelor’s Thesis deals with coding identification of coding regions using DNA spectrogram analysis. The theoretical part describes numerical representations of genomic data and methods for editing DNA sequences. The types of methods used for DNA spektrogram construction and characteristic patterns detected by spectrogram are described. The most used method for data processing is discrete Fourier transformation that enables us to scan sequences for required data. There is also a theoretical part about creating a spectrogram and a list of detected samples. Knowledge of this is used to program specific methods in Matlab. We created a program for detection of coding parts in Spectrogram and defining their accurate positions in the sequence. Acquired results are discussed and compared with the NCBI database at the end of this work.en
dc.description.markBcs
dc.identifier.citationSPÍCHALOVÁ, B. Vyhledávání kódujících úseků pomocí analýzy DNA spektrogramu [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2013.cs
dc.identifier.other65429cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/26183
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectSekvence DNAcs
dc.subjectdiskrétní Fourierova transformacecs
dc.subjectkódující oblasti DNAcs
dc.subjectspektrogram.cs
dc.subjectDNA sequenceen
dc.subjectdiscrete Fourier transformen
dc.subjectcoding region of the DNAen
dc.subjectspectrogram.en
dc.titleVyhledávání kódujících úseků pomocí analýzy DNA spektrogramucs
dc.title.alternativeIdentification of coding regions using DNA spectrogram analysisen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2013-06-20cs
dcterms.modified2013-06-24-09:48:27cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid65429en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.16 13:25:01en
sync.item.modts2025.01.15 22:44:24en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
1.78 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
4.05 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_65429.html
Size:
4 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_65429.html
Download
Collections
2013