Segmentace struktur mikroskopických dat mozku

Abstract

Táto práca za zaoberá spracovaním obrazových medicínskych dát za pomoci programovacieho jazyka Java. Hlavný prínos práce je vytvorenie algoritmov pre extrakciu príznakov z 3D dát a následné overenie výsledkov pre problematiku zobrazovania mikroskopických 3D dát mozgu a vo vytvorení obrazových filtrov, ktoré sú vytvorené vo forme operátorov pre program RapidMiner. Následne je vytvorený segmentačný proces na úrovni 2D a 3D, ktorého výstupom sú 3D štruktúry nasegmentovaných buniek mozgu. Ďalej boli porovnané segmentačné algoritmy na základe výslednej formy segmentovaných štruktúr a porovnanie tohoto prístupu s inými prácami.This thesis is involved in image processing of medical data and its implementation using Java programming language. The main contribution of this thesis is creation of algorithms for feature extraction from 3D data and subsequent verification of the results for the issue of imagining 3D brain data, and creation of image filters and their implementation in the program RapidMiner. Consequently, the segmentation process is created at the 2D and 3D level, and output of 3D level segmentation are segmented brain structures. Furthermore, segmentation algorithms were compared on the basis of the final form of segmented structures and this approach was compared with other works.