Srovnání genomů analýzou pozice genů

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Aleš Drastich, CSc. (místopředseda) Ing. Milan Blaha, Ph.D. (člen) MUDr. Zuzana Nováková, Ph.D. (člen) MUDr. Šárka Sekorová (člen) Ing. Denisa Maděránková, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Škutková: Jak se hodnotí translokace genů, pokud se dostaly na jiný chromozom? Ing. Maděránková: Při srovnání vysoce odlišných organismů, má vliv pořadí chromozomů? doc. Kolář: Proč byly použity částečně reálné sekvence? Výpočetní náročnost, paralelizace. Student obhájil bakalářskou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorMaděránková, Denisacs
dc.contributor.authorPavel, Tomášcs
dc.contributor.refereeVítková, Helenacs
dc.date.created2014cs
dc.description.abstractTeoretická část této bakalářské práce se zabývá základy genetiky. Nejprve jsou popsány pojmy gen a mutace. Jsou popsány mutace genové a chromozomové. Následující část je věnována komparativní genomice a především synteny. Je zde popsáno, co je to synteny a jak vzniká. Konec teoretické části je věnován evoluci a způsobům třídění permutačních vektorů. Praktická část bakalářské práce obsahuje popis vytvořeného programu. Výstupem programu je dotplot zobrazující synteny bloky, jejichž indexy jsou vypsány v GUI. Druhým podstatným výstupem je stanovení počtu permutačních kroků. Tento počet kroků slouží ke stanovení evoluční vzdálenosti porovnávaných sekvencí. Poslední část práce je věnována testování programu a analýze uměle vytvořených a reálných sekvencí DNA.cs
dc.description.abstractThe theoretical part of this bachelor thesis is aimed at basics of genetics. Term of gene and mutation are introduced in this section. There are gene and chromosome mutations mentioned and described. Following section is devoted to comparative genomics and especially to synteny. There is described what the synteny actually is and how the synteny arises. The end of the theoretical part of this thesis is about the evolution and there are described ways of sorting permutation vectors. The practical part of this bachelor thesis includes description of developed software. Output of this software is a dot-plot which shows detected synteny blocks. Indexes of these blocks are listed in GUI. The second important output is number of permutation steps. This number determines evolutionary distance between two analysed DNA sequences. The very last section is aimed at analyse of synthetic and real DNA sequences.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationPAVEL, T. Srovnání genomů analýzou pozice genů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2014.cs
dc.identifier.other72855cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/33267
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectDNAcs
dc.subjectsyntenycs
dc.subjectkomparativní genomikacs
dc.subjectgencs
dc.subjectgenomcs
dc.subjectmutacecs
dc.subjectpermutacecs
dc.subjectinverzecs
dc.subjecttranspozicecs
dc.subjectDNAen
dc.subjectsyntenyen
dc.subjectcomparative genomicsen
dc.subjectgenen
dc.subjectgenomeen
dc.subjectmutationsen
dc.subjectpermutationsen
dc.subjectreversalen
dc.subjecttranspositionen
dc.titleSrovnání genomů analýzou pozice genůcs
dc.title.alternativeComparison of genomes by synteny block analysisen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2014-06-18cs
dcterms.modified2014-06-20-10:10:46cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid72855en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.16 13:29:50en
sync.item.modts2025.01.17 12:26:30en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
2.91 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
file final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
59.6 KB
Format:
Unknown data format
Description:
file appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_72855.html
Size:
4.87 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_72855.html
Download
Collections
2014