Pozitivní a negativní selekce mitochondriálního genomu

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Jiří Kozumplík, CSc. (předseda) prof.Ing. Marek Penhaker, Ph.D. (místopředseda) Ing. Helena Škutková, Ph.D. (člen) Ing. Martin Mézl, Ph.D. (člen) MUDr. Zuzana Nováková, Ph.D. (člen) Mgr. Erik Staffa, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Student neobhájil bakalářskou práci.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce nebyla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorMaděránková, Denisacs
dc.contributor.authorSvoboda, Matějcs
dc.contributor.refereeKupková, Kristýnacs
dc.date.accessioned2021-11-08T12:56:51Z
dc.date.available2021-11-08T12:56:51Z
dc.date.created2017cs
dc.description.abstractBakalářská práce se zabývá problematikou pozitivní a negativní selekce mitochondriálního genomu. Práce je rozdělena na dvě části. První část se věnuje teorii a vysvětlení základních pojmů, konkrétně popisuje mitochondriální genom, nukleotidové mutace, pozitivní a negativní selekci a v neposlední řadě evoluční modely. Druhá část je zaměřena na praktické zpracování mitochondriální DNA a vytvoření funkcí v programovacím prostředí R. Důraz je kladen především na zarovnání sekvencí genů a hledání substitucí. Získané výsledky jsou následně porovnávány s výstupy z programů PAML a KaKs Calculator.cs
dc.description.abstractThe bachelor thesis engages with problematics of positive and negative selection of mitochondrial genome. Thesis is divided into two parts. First part grapples with theory and explanation of fundamental definitions, in particular understates mitochondrial genome, nucleotide mutation, positive and negative selection and furthermore evolution models. Second part focuses on processing mitochondrial DNA practically and on establishing functions in programming environment R. The emphasis is foremost on gene sequencing alignment and exploring substitutions. Consequently, obtained outcomes are contrasted with PAML and KaKs Calculator programme outcomes.en
dc.description.markFcs
dc.identifier.citationSVOBODA, M. Pozitivní a negativní selekce mitochondriálního genomu [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2017.cs
dc.identifier.other102807cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/68130
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectDNAcs
dc.subjectevoluční modelycs
dc.subjectgenomcs
dc.subjectmitochondriecs
dc.subjectnegativní selekcecs
dc.subjectPAMLcs
dc.subjectpositivní selekcecs
dc.subjectR Studiocs
dc.subjectDNAen
dc.subjectevolution modelen
dc.subjectgenomeen
dc.subjectmitochondriaen
dc.subjectnegative selectionen
dc.subjectPAMLen
dc.subjectpositive selectionen
dc.subjectR Studioen
dc.titlePozitivní a negativní selekce mitochondriálního genomucs
dc.title.alternativePozitive and negative selection of mitochondrial genomeen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2017-06-19cs
dcterms.modified2018-06-14-16:13:47cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid102807en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.08 13:56:51en
sync.item.modts2021.11.08 12:53:36en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
1.58 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
132.08 KB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_102807.html
Size:
8.3 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_102807.html
Download
Collections
2017