Reprezentace a zpracování genomických signálů
Loading...
Date
Authors
Pitner, Vít
ORCID
Advisor
Referee
Mark
D
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract
Tato práce se zabývá metodami reprezentace a zpracování genomických signálů. V první části práce je postupně probrán lineární zápis sekvencí a statistický popis sekvencí. K tomuto účelu byla využita reálná data, načtená z veřejné databáze, konkrétně sekvence genu pro lidský chromozom Y. V další části práce jsou postupně probrány vybrané metody zpracování a reprezentace genomických signálů. Dále je popsán vytvořený program pro zpracování sekvencí a je otestován pro krátké genomické sekvence, načtené z veřejné databáze.
This project deals with methods of representation and processing of genomic signals. The first part of this thesis describe linear expression of the sequence and statistical description of the sequence. For this purpose was used the real data, retrieved from public database, specifically the gene sequence of human chromosome Y. In the second part of the thesis are explained some methods of processing and representation of genomic signals. The following part describes a program designed for the processing sequence and is tested for short genomic sequences retrieved from public databases.
This project deals with methods of representation and processing of genomic signals. The first part of this thesis describe linear expression of the sequence and statistical description of the sequence. For this purpose was used the real data, retrieved from public database, specifically the gene sequence of human chromosome Y. In the second part of the thesis are explained some methods of processing and representation of genomic signals. The following part describes a program designed for the processing sequence and is tested for short genomic sequences retrieved from public databases.
Description
Keywords
Genomická sekvence, Proteomická sekvence, lineární zápis, statistický popis, vektorová reprezentace, komplexní reprezentace, Chaos game reprezentace, Chaos game obrazy, Pyramid diagram, Pygram, Spektrum like reprezentace, PSM, Power spektrum metoda, metoda Yau, Genomic sequence, proteomic sequence, linear expression, statistical description, vector representation, complex representation, Chaos game representation, Chaos game images, Pyramid diagram, Pygram, Spectrum like representation, PSM, Power spectrum method, Yau method
Citation
PITNER, V. Reprezentace a zpracování genomických signálů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2011.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Biomedicínská technika a bioinformatika
Comittee
prof. Ing. Valentýna Provazník, Ph.D. (předseda)
doc. Ing. Jiří Rozman, CSc. (místopředseda)
doc. Ing. Daniel Schwarz, Ph.D. (člen)
prof. MUDr. Marie Nováková, Ph.D. (člen)
MUDr. Lenka Forýtková, CSc. (člen)
Date of acceptance
2011-06-16
Defence
Student obhájil bakalářskou práci s výhradami a odpověděl na otázky oponenta.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení