Vliv numerických reprezentací DNA na úspěšnost molekulární taxonomie

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Aleš Drastich, CSc. (místopředseda) Ing. Milan Blaha, Ph.D. (člen) MUDr. Zuzana Nováková, Ph.D. (člen) MUDr. Šárka Sekorová (člen) Ing. Denisa Maděránková, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Blaha: Skutečně je lepší identifikace druhů, než rodů? Čím je to dáno? doc. Kolář: Jaké je srovnání s publikovanými metodami? Student obhájil bakalářskou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorMaděránková, Denisacs
dc.contributor.authorBlaschová, Eliškacs
dc.contributor.refereeProvazník, Valentýnacs
dc.date.created2014cs
dc.description.abstractPráce seznamuje s klasickou a molekulární taxonomií, které se používají ke klasifikaci organismů. Představuje směr DNA barcodingu jako možnost jak přiřadit neznámý vzorek organismu k známému druhu. Získané sekvence mitochondriální DNA při DNA barcodingu je třeba zpracovat vhodnou metodou numerické reprezentace, která bude správně informovat o příslušnosti neznámého organismu k druhům a dokáže jej tedy správně zařadit. V této práci jsou použity k porovnání sekvencí organismů celkem tři metody numerické reprezentace, a to 1. a 4. kvadrant, EIIP hodnoty a třívektorová reprezentace. V praktické části je naprogramována identifikační analýza, která přiřazuje testovaným organismům referenční organismus. Testování je provedeno na 4 referenčních souborech a 5 analyzovaných souborech. Práce shrnuje úspěšnost přiřazení správné reference pro vybrané metody numerické reprezentace.cs
dc.description.abstractThis paper introduces the classical and molecular taxonomy used for classification of organisms. It represents the direction of DNA barcoding as a possibility to identify unknown organism. Acquired mitochondrial DNA sequences in DNA barcoding can by transform by suitable method to numerical representation that will properly inform about the organisms relationship to other taxa. In this work, we consider three methods of numerical representation: the 1st and 4th quadrant EIIP values and 3D numerical representation reduction. The practical part is programmed identification analysis, which assigns the test organisms reference organism. Testing is performed at 4 reference files and analyzed 5 files. The work summarized the success assigning the correct reference for the selected method of numerical representation.en
dc.description.markBcs
dc.identifier.citationBLASCHOVÁ, E. Vliv numerických reprezentací DNA na úspěšnost molekulární taxonomie [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2014.cs
dc.identifier.other72803cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/33413
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectMolekulární taxonomiecs
dc.subjectmitochondriální DNAcs
dc.subjectDNA barcodingcs
dc.subjectnumerické reprezentacecs
dc.subjectMolecular taxonomyen
dc.subjectmitochondrial DNAen
dc.subjectDNA barcodingen
dc.subjectnumerical representationen
dc.titleVliv numerických reprezentací DNA na úspěšnost molekulární taxonomiecs
dc.title.alternativeEffect of different numerical representations of DNA on molecular taxonomyen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2014-06-18cs
dcterms.modified2014-06-20-10:10:39cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid72803en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.16 13:30:05en
sync.item.modts2025.01.15 14:50:22en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
2.05 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
1.18 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_72803.html
Size:
4.93 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_72803.html
Download
Collections
2014