but.committee	prof. Ewaryst Tkacz, Ph.D.,D.Sc. (předseda) Ing. Martin Vítek, Ph.D. (místopředseda) doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (člen) Ing. Jan Červený, Ph.D. (člen) Mgr. Helena Durnová, Ph.D. (člen)	cs
but.defence	Studentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Doc. Kolářová položila otázku: Jaká je úspěšnost detekce? Ing. Vítek položil otázku: Jak řešíte dělení buněk ve shlucích a jak jsou odstraněny falešné detekce? Studentka obhájila diplomovou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.	cs
but.jazyk	čeština (Czech)
but.program	Biomedicínské inženýrství a bioinformatika	cs
but.result	práce byla úspěšně obhájena	cs
dc.contributor.advisor	Červený,, Jan	cs
dc.contributor.author	Vlachynská, Alžběta	cs
dc.contributor.referee	Búzová,, Diana	cs
dc.date.created	2015	cs
dc.description.abstract	Tato práce byla řešena ve spolupráci s Oddělením adaptivních biotechnologií, Centra globální změny AV ČR. Zabývá se kvantitativní analýzou fotosyntetických buněčných kultur. Využívá obrazů nasnímaných pomocí konfokálního fluorescenčního mikroskopu pro automatické stanovení počtu buněk ve vzorku. Práce sestává z teoretického rozboru, kde stručně popisuje fluorescenční a konfokální mikroskopii. Krátce představuje i mikroskop Leica TCS SP8 X, pomocí kterého byly snímány data. Jedna kapitola je věnována teorii číslicového zpracování obrazů. Druhá část popisuje návrh algoritmu pro zpracování 3D dat a zjednodušený algoritmus pro zpracování 2D dat a jeho programovou realizaci v programovacím prostředí MATLAB R2013b. Podrobně je posáno vytvořené uživatelské prostředí programu. Na závěr jsou prezentována provedená měření. Je popsán sestavený protokol přípravy vzorků. Výsledky programu jsou porovnány s ručním počítáním. Pomocí programu byl stanoven počet buněk na 1ml ve vzorcích buněčných kultur Chenopodium rubrum (Cr) a Solanum lycopersicum (To).	cs
dc.description.abstract	This work was carried out in collaboration with the Department of Adaptive Biotechnologies, Global Change Research Centre AS CR. It deals with the quantitative analysis of photosynthetic cell cultures. It uses images captured by a confocal fluorescent microscope to the automatic determining the number of cells in the sample. The work consists of a theoretical analysis, which briefly describes fluorescence and confocal microscopy. It also concisely introduces a microscope Leica TCS SP8 X, which I used to scan data. One capture is devoted to the theory of digital image processing. The second part deskribes the development of algorithm for processing 3D data and simplified algorithm for processing 2D data and its program implementations in a programming environment MATLAB R2013b. Grafical user interface is explained in detail. Done measurement are presented at the conclusion. It mentions compiled sample preparation protocol. The results of the program are compared with manual counting. Number of cells per 1 ml are determined by created program in samples of cell cultures Chenopodium rubrum (Cr) and Solanum lycopersicum (To).	en
dc.description.mark	A	cs
dc.identifier.citation	VLACHYNSKÁ, A. Metody pro obrazovou analýzu populace fotosyntetických buněčných kultur [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2015.	cs
dc.identifier.other	84460	cs
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11012/38930
dc.language.iso	cs	cs
dc.publisher	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií	cs
dc.rights	Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení	cs
dc.subject	Fotosyntetické buněčné kultury	cs
dc.subject	konfokální mikroskopie	cs
dc.subject	fluorescenční obrazové signály	cs
dc.subject	zpracování 3D dat	cs
dc.subject	automatické počítání buněk	cs
dc.subject	Chenopodium rubrum	cs
dc.subject	Solanum lycopersicum	cs
dc.subject	Photosynthetic cell culture	en
dc.subject	confocal microscopy	en
dc.subject	fluorescence image signals	en
dc.subject	processing the 3D data	en
dc.subject	automatic cell counting	en
dc.subject	Chenopodium rubrum	en
dc.subject	Solanum lycopersicum	en
dc.title	Metody pro obrazovou analýzu populace fotosyntetických buněčných kultur	cs
dc.title.alternative	Photosynthetic cell suspension cultures quantitative image data processing	en
dc.type	Text	cs
dc.type.driver	masterThesis	en
dc.type.evskp	diplomová práce	cs
dcterms.dateAccepted	2015-06-09	cs
dcterms.modified	2015-06-15-07:23:25	cs
eprints.affiliatedInstitution.faculty	Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií	cs
sync.item.dbid	84460	en
sync.item.dbtype	ZP	en
sync.item.insts	2025.03.26 13:18:12	en
sync.item.modts	2025.01.15 21:34:28	en
thesis.discipline	Biomedicínské inženýrství a bioinformatika	cs
thesis.grantor	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrství	cs
thesis.level	Inženýrský	cs
thesis.name	Ing.	cs

Metody pro obrazovou analýzu populace fotosyntetických buněčných kultur

Files

Original bundle

Collections