but.committee	prof. Ing. Jiří Švejcar, CSc. (předseda) Ing. Ondřej Číp, Ph.D. (člen) doc. Ing. Pavel Štarha, Ph.D. (člen) prof. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D. (člen) prof. RNDr. Miroslav Liška, DrSc. (člen)	cs
but.defence	Autor prezentoval návrh algoritmů v obou oblastech využití, tzn. v počítačové tomografiia v holografické mikroskopii. Výsledky byly publikovány v časopisech. Originální řešení je již využíváno na dvou zahraničních pracovištích ve Spojeném království a ve firmě TESCAN. Výsledky přispěl k rozvoji vědeckého poznání v oboru pokročilého zpracování 3D obrazů.	cs
but.jazyk	čeština (Czech)
but.program	Fyzikální a materiálové inženýrství	cs
but.result	práce byla úspěšně obhájena	cs
dc.contributor.advisor	Chmelík, Radim	cs
dc.contributor.author	Kvasnica, Lukáš	cs
dc.contributor.referee	Číp, Ondřej	cs
dc.contributor.referee	Štarha, Pavel	cs
dc.date.accessioned	2019-06-14T11:05:22Z
dc.date.available	2019-06-14T11:05:22Z
dc.date.created	2015	cs
dc.description.abstract	Disertační práce se zabývá metodami počítačového zpracování obrazových dat v rentgenové mikrotomografii a v digitální holografické mikroskopii. Práce si klade za cíl dosáhnout optimalizací a využitím masivně paralelních grafických karet (GPU -- graphic processing unit) výrazného zrychlení algoritmů jak pro rekonstrukci tomografického zobrazení, tak pro rekonstrukci obrazu v holografické mikroskopii. V oblasti mikrotomografie předkládá práce nové GPU akcelerované implementace filtrované zpětné projekce a filtrace zpětné projekce derivovaných dat. Dále je představena technika normalizace orientace a vyhodnocení 3D tomografických dat. V části týkající se holografické mikroskopie je uveden popis jednotlivých kroků celého zpracování obrazu. Je představena nová původní technika navazování a korekce obrazové fáze poškozené výskytem optických vírů v nenavázané obrazové fázi. Následuje popis rychlé GPU implementace metody kompenzace deformací obrazové fáze a techniky trasování buněk. V závěru je krátce představen program Q-PHASE, který je výsledkem spojení všech algoritmů nezbytných jak pro ovládání, tak rekonstrukci obrazu v holografickém mikroskopu.	cs
dc.description.abstract	This dissertation thesis deals with the methods for processing image data in X-ray microtomography and digital holographic microscopy. The work aims to achieve significant acceleration of algorithms for tomographic reconstruction and image reconstruction in holographic microscopy by means of optimization and the use of massively parallel GPU. In the field of microtomography, the new GPU (graphic processing unit) accelerated implementations of filtered back projection and back projection filtration of derived data are presented. Another presented algorithm is the orientation normalization technique and evaluation of 3D tomographic data. In the part related to holographic microscopy, the individual steps of the complete image processing procedure are described. This part introduces the new orignal technique of phase unwrapping and correction of image phase damaged by the occurrence of optical vortices in the wrapped image phase. The implementation of the methods for the compensation of the phase deformation and for tracking of cells is then described. In conclusion, there is briefly introduced the Q-PHASE software, which is the complete bundle of all the algorithms necessary for the holographic microscope control, and holographic image processing.	en
dc.description.mark	P	cs
dc.identifier.citation	KVASNICA, L. Digitální metody zpracování trojrozměrného zobrazení v rentgenové tomografii a holografické mikroskopii [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství. 2015.	cs
dc.identifier.other	89406	cs
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11012/51870
dc.language.iso	cs	cs
dc.publisher	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství	cs
dc.rights	Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení	cs
dc.subject	počítačová tomografie	cs
dc.subject	digitální holografická mikroskopie	cs
dc.subject	kompenzace aberací	cs
dc.subject	navazování fáze	cs
dc.subject	GPU akcelerace	cs
dc.subject	optické víry	cs
dc.subject	konečná inverzní Hilbertova transformace	cs
dc.subject	filtrovaná zpětná projekce	cs
dc.subject	computed tomography	en
dc.subject	digital holographic microscopy	en
dc.subject	aberration compensation	en
dc.subject	phase unwrapping	en
dc.subject	GPU acceleration	en
dc.subject	optical vortices	en
dc.subject	finite inverse Hilbert transform	en
dc.subject	filtered back projection	en
dc.title	Digitální metody zpracování trojrozměrného zobrazení v rentgenové tomografii a holografické mikroskopii	cs
dc.title.alternative	The Three-Dimensional Digital Imaging Methods for X-ray Computed Tomography and Digital Holographic Microscopy	en
dc.type	Text	cs
dc.type.driver	doctoralThesis	en
dc.type.evskp	dizertační práce	cs
dcterms.dateAccepted	2015-12-17	cs
dcterms.modified	2016-01-05-08:47:45	cs
eprints.affiliatedInstitution.faculty	Fakulta strojního inženýrství	cs
sync.item.dbid	89406	en
sync.item.dbtype	ZP	en
sync.item.insts	2020.04.01 10:23:54	en
sync.item.modts	2020.04.01 05:06:12	en
thesis.discipline	Fyzikální a materiálové inženýrství	cs
thesis.grantor	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství. Ústav fyzikálního inženýrství	cs
thesis.level	Doktorský	cs
thesis.name	Ph.D.	cs

Digitální metody zpracování trojrozměrného zobrazení v rentgenové tomografii a holografické mikroskopii

Files

Original bundle

Collections