Vývoj meta-serveru pro předpověď vlivu mutací na funkci proteinu

Simple item page
but.committeecs
but.defencecs
but.jazykčeština (Czech)
but.programInformační technologiecs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorJaša, Petrcs
dc.contributor.authorLisák, Petercs
dc.contributor.refereeBurgetová, Ivanacs
dc.date.accessioned2018-10-21T21:38:06Z
dc.date.available2018-10-21T21:38:06Z
dc.date.created2009cs
dc.description.abstractTato bakalářská práce se zabývá analýzou genomických dat, konkrétně předpovědí vlivu mutací na funkci proteinů z jejich sekvence a terciární struktury. V teoretickém úvodu práce shrnuje základy genetiky a bioinformatiky. Ve výsledkové části se práce zaměřuje na predikční nástroje SIFT, MAPP a AUTO-MUTE. Navrhuje způsob jednotného rozhraní pro práci s těmito nástroji. Společné rozhraní umožňuje zadávat výpočty a sbírat výsledky různých nástrojů z jednoho místa. Ze získaných dat predikuje vlastní konsensuální výsledek s očekávanou vyšší přesností než jednotlivé nástroje. Závěr práce je věnovaný testování aplikace na skutečných datech a porovnání předpovědí s experimentálně získanými výsledky.cs
dc.description.abstractThis bachelor thesis deals with analysis of genomic data, more specifically prediction of effects of mutations on protein function using a protein sequence or tertiary structure. The theoretical introduction describes the basics of genetics and bioinformatics and is followed by description of selected prediction tools such as SIFT, MAPP and AUTO-MUTE. A unified interface for work with different tools is proposed in the thesis. The meta-server interface allows running a computation and collecting results from one site. meta-server combines results of implemented tools and provides a consensual prediction, which is expected to be more accurate than the results from individual tools. Finally, testing of meta-server on the real data and comparisons of predictions with the experimentally obtained results are presented.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationLISÁK, P. Vývoj meta-serveru pro předpověď vlivu mutací na funkci proteinu [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2009.cs
dc.identifier.other25786cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/54611
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectbioinformatikacs
dc.subjectgenetikacs
dc.subjectproteincs
dc.subjectmutacecs
dc.subjectsubstitucecs
dc.subjectpredikční nástrojcs
dc.subjectkonsenzuscs
dc.subjectSIFTcs
dc.subjectMAPPcs
dc.subjectAUTO-MUTEcs
dc.subjectLLWScs
dc.subjectmeta-servercs
dc.subjectbioinformaticsen
dc.subjectgeneticsen
dc.subjectproteinen
dc.subjectmutationen
dc.subjectsubstitutionen
dc.subjectprediction toolen
dc.subjectconsensusen
dc.subjectSIFTen
dc.subjectMAPPen
dc.subjectAUTO-MUTEen
dc.subjectLLWSen
dc.subjectmeta-serveren
dc.titleVývoj meta-serveru pro předpověď vlivu mutací na funkci proteinucs
dc.title.alternativeDevelopment of Meta-Server for Prediction of Mutations Effects on Protein Functionen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2009-06-17cs
dcterms.modified2020-05-09-23:41:22cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta informačních technologiícs
sync.item.dbid25786en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2020.05.10 01:04:49en
sync.item.modts2020.05.10 00:32:17en
thesis.disciplineInformační technologiecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav informačních systémůcs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 2 of 2
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
584.43 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
review_25786.html
Size:
1.46 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_25786.html
Download
Collections
2009