Vývoj meta-serveru pro předpověď vlivu mutací na funkci proteinu

Simple item page
but.jazykčeština (Czech)
but.programInformační technologiecs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorJaša, Petrcs
dc.contributor.authorLisák, Petercs
dc.contributor.refereeBurgetová, Ivanacs
dc.date.createdcs
dc.description.abstractTato bakalářská práce se zabývá analýzou genomických dat, konkrétně předpovědí vlivu mutací na funkci proteinů z jejich sekvence a terciární struktury. V teoretickém úvodu práce shrnuje základy genetiky a bioinformatiky. Ve výsledkové části se práce zaměřuje na predikční nástroje SIFT, MAPP a AUTO-MUTE. Navrhuje způsob jednotného rozhraní pro práci s těmito nástroji. Společné rozhraní umožňuje zadávat výpočty a sbírat výsledky různých nástrojů z jednoho místa. Ze získaných dat predikuje vlastní konsensuální výsledek s očekávanou vyšší přesností než jednotlivé nástroje. Závěr práce je věnovaný testování aplikace na skutečných datech a porovnání předpovědí s experimentálně získanými výsledky.cs
dc.description.abstractThis bachelor thesis deals with analysis of genomic data, more specifically prediction of effects of mutations on protein function using a protein sequence or tertiary structure. The theoretical introduction describes the basics of genetics and bioinformatics and is followed by description of selected prediction tools such as SIFT, MAPP and AUTO-MUTE. A unified interface for work with different tools is proposed in the thesis. The meta-server interface allows running a computation and collecting results from one site. meta-server combines results of implemented tools and provides a consensual prediction, which is expected to be more accurate than the results from individual tools. Finally, testing of meta-server on the real data and comparisons of predictions with the experimentally obtained results are presented.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationLISÁK, P. Vývoj meta-serveru pro předpověď vlivu mutací na funkci proteinu [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. .cs
dc.identifier.other25786cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/54611
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologiícs
dc.rightsPřístup k plnému textu prostřednictvím internetu byl licenční smlouvou omezen na dobu 3 roku/letcs
dc.subjectbioinformatikacs
dc.subjectgenetikacs
dc.subjectproteincs
dc.subjectmutacecs
dc.subjectsubstitucecs
dc.subjectpredikční nástrojcs
dc.subjectkonsenzuscs
dc.subjectSIFTcs
dc.subjectMAPPcs
dc.subjectAUTO-MUTEcs
dc.subjectLLWScs
dc.subjectmeta-servercs
dc.subjectbioinformaticsen
dc.subjectgeneticsen
dc.subjectproteinen
dc.subjectmutationen
dc.subjectsubstitutionen
dc.subjectprediction toolen
dc.subjectconsensusen
dc.subjectSIFTen
dc.subjectMAPPen
dc.subjectAUTO-MUTEen
dc.subjectLLWSen
dc.subjectmeta-serveren
dc.titleVývoj meta-serveru pro předpověď vlivu mutací na funkci proteinucs
dc.title.alternativeDevelopment of Meta-Server for Prediction of Mutations Effects on Protein Functionen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.modified2020-05-09-23:41:22cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta informačních technologiícs
sync.item.dbid25786en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.19 16:53:42en
sync.item.modts2025.01.17 12:06:41en
thesis.disciplineInformační technologiecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav informačních systémůcs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 1 of 1
Thumbnail Image
Name:
review_25786.html
Size:
1.45 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_25786.html
Download
Collections
2008