Evoluční strategie v úloze anotace funkce nukleotidového polymorfismu
| but.committee | prof. Ing. Tomáš Vojnar, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Vladimír Drábek, CSc. (místopředseda) doc. Ing. Radek Burget, Ph.D. (člen) doc. Ing. Tomáš Martínek, Ph.D. (člen) Ing. Petr Schwarz, Ph.D. (člen) | cs |
| but.defence | Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se pak seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm A . Otázky u obhajoby: Uvažujete o zveřejnění vytvořeného nástroje odborné veřejnosti? Na kolik je Váš systém modulární ve smyslu přidání/odebrání nového nástroje pro predikci aminokyselinových mutací a opětovného natrénování vah konsensuální funkce? | cs |
| but.jazyk | čeština (Czech) | |
| but.program | Informační technologie | cs |
| but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
| dc.contributor.advisor | Bendl, Jaroslav | cs |
| dc.contributor.author | Šalanda, Ondřej | cs |
| dc.contributor.referee | Martínek, Tomáš | cs |
| dc.date.created | 2013 | cs |
| dc.description.abstract | Tato práce prezentuje nový přístup k predikci vlivu nukleotidového polymorfismu na funkci proteinu. Cílem je vytvořit nový metanástroj, který pomocí váhového konsensu kombinuje vlastnosti osmi již existujících nástrojů za účelem zvýšení přesnosti a univerzálnosti predikce. K nalezení vhodného rozložení vah je přistoupeno inovativně, používá se evoluční strategie. Parametry pro její spuštění jsou zjištěny experimentálně. Na závěr je uvedeno zhodnocení úspěšnosti nového nástroje a porovnání výsledků na testovacích sadách. | cs |
| dc.description.abstract | This thesis brings a new approach to the prediction of the the effect of amino acid substitution. The main goal is to create a new meta-tool, which combines evaluations of eight already implemented prediction tools. The use of weighted consensus over those tools should lead to better accuracy and versatility of prediction. The novelty of developed tool lies in involving evolution strategy with experimentally defined parameters as a way to determine the best weight distribution. At the end, a complex comparison and evaluation of results is given. | en |
| dc.description.mark | A | cs |
| dc.identifier.citation | ŠALANDA, O. Evoluční strategie v úloze anotace funkce nukleotidového polymorfismu [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2013. | cs |
| dc.identifier.other | 79314 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/54995 | |
| dc.language.iso | cs | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | Protein | cs |
| dc.subject | mutace | cs |
| dc.subject | jednoduchý nukleotidový polymorfismus | cs |
| dc.subject | evoluční strategie | cs |
| dc.subject | váhový konsensus. | cs |
| dc.subject | Protein | en |
| dc.subject | mutation | en |
| dc.subject | simple nucleotide polymorphism | en |
| dc.subject | evolution strategy | en |
| dc.subject | weighted consensus. | en |
| dc.title | Evoluční strategie v úloze anotace funkce nukleotidového polymorfismu | cs |
| dc.title.alternative | Functional Annotation of Nucleotide Polymorphism Using Evolution Strategy | en |
| dc.type | Text | cs |
| dc.type.driver | bachelorThesis | en |
| dc.type.evskp | bakalářská práce | cs |
| dcterms.dateAccepted | 2013-06-13 | cs |
| dcterms.modified | 2020-05-10-16:11:10 | cs |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta informačních technologií | cs |
| sync.item.dbid | 79314 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2025.03.18 18:00:32 | en |
| sync.item.modts | 2025.01.17 14:16:38 | en |
| thesis.discipline | Informační technologie | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav informačních systémů | cs |
| thesis.level | Bakalářský | cs |
| thesis.name | Bc. | cs |