Analýza trombu ve vícefázických CT datech u ischemické mozkové příhody
Loading...
Date
Authors
Mikešová, Tereza
ORCID
Advisor
Referee
Mark
A
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract
Diplomová práce se zabývá analýzou trombů v mozkových vícefázických CT datech. V teoretické části práce je vypracována rešerše metod zejména segmentace trombů. Dále je v této části shrnutá anatomie mozkových tepen a přiblížena cévní mozková příhoda. Stručně jsou popsány vybrané metody z oblasti zpracování obrazu. Výsledkem praktické části je porovnání metod segmentace trombů. Samotné segmentaci předcházelo předzpracování dat, které je v práci popsáno, a vytvoření manuální anotační databáze. Nejlepší implementovanou metodou se ukázala metoda adaptivního prahování, která dosáhla Dice skóre 0,4555. Vhodným zkombinováním všech metod bylo dosaženo finálního Dice skóre 0,5145. Ze segmentovaných objemů byly následně vypočítány parametry trombů. Mediánová hodnota průměrné intenzity dosáhla na 51,55 HU, medián délky byl 15,16 mm a mediánový objem byl stanoven na 65,34 mm3. Následná korelační analýza neukázala žádný významný vztah mezi odvozenými parametry.
This master thesis deals with analysis of ischemic thrombus in brain CT scans. In theoretical part, a review of methods, especially thrombus segmentation, is developed. Furthermore, the anatomy of cerebral arteries and acute ischemic stroke is summarized. Selected methods from the field of image processing are briefly described. The practical part results in a comparison of thrombus segmentation methods. The segmentation itself was preceded by data preprocessing, which is described in the theses, and the creation of a manual annotation database. The best implemented method was found to be the adaptive thresholding method, which achieved a Dice score of 0,4555. By combining the methods appropriately, a final Dice score of 0,5145 was achieved. Thrombus parameters were then calculated from the segmented volumes. The median intensity value was 51,55~HU, the median length was 15,16 mm, and the median volume was determined to be 65,34 mm3. Subsequent correlation analysis showed no significant relationship between the derived parameters.
This master thesis deals with analysis of ischemic thrombus in brain CT scans. In theoretical part, a review of methods, especially thrombus segmentation, is developed. Furthermore, the anatomy of cerebral arteries and acute ischemic stroke is summarized. Selected methods from the field of image processing are briefly described. The practical part results in a comparison of thrombus segmentation methods. The segmentation itself was preceded by data preprocessing, which is described in the theses, and the creation of a manual annotation database. The best implemented method was found to be the adaptive thresholding method, which achieved a Dice score of 0,4555. By combining the methods appropriately, a final Dice score of 0,5145 was achieved. Thrombus parameters were then calculated from the segmented volumes. The median intensity value was 51,55~HU, the median length was 15,16 mm, and the median volume was determined to be 65,34 mm3. Subsequent correlation analysis showed no significant relationship between the derived parameters.
Description
Citation
MIKEŠOVÁ, T. Analýza trombu ve vícefázických CT datech u ischemické mozkové příhody [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2023.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
bez specializace
Comittee
doc. Ing. Daniel Schwarz, Ph.D. (předseda)
doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (místopředseda)
Ing. Tomáš Vičar, Ph.D. (člen)
Ing. Vratislav Harabiš, Ph.D. (člen)
doc. Mgr. Ing. Karel Sedlář, Ph.D. (člen)
Ing. Martin Mézl, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2023-06-07
Defence
Studentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Mézl položil dotaz na kroky finální segmentace a použitá data. Dále se zeptal na srovnání s metodikou uvedenou v použité literatuře. Doc. Schwarz položil dotaz ohledně statistické části práce. Ing. Harabiš položil dotaz na podobnostní kritérium. Mgr. Ing. Sedlář se zajímal o take-home message a využitelnost práce v budoucnu. Ing. Vičar se zeptal na kombinaci metod a zvolený práh. Studentka obhájila diplomovou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení