Enterobacter spp. rezistentné k beta-laktamovým antibiotikám z mestských a nemocničných odpadných vôd
| but.committee | prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (předseda) prof. Ing. Stanislav Obruča, Ph.D. (místopředseda) doc. Ing. Pavel Diviš, Ph.D. (člen) doc. Ing. Eva Vítová, Ph.D. (člen) doc. RNDr. Renata Mikulíková, Ph.D. (člen) doc. Mgr. Václav Brázda, Ph.D. (člen) prof. Ing. Stanislav Kráčmar, DrSc. (člen) | cs |
| but.defence | 1. Studentka seznámila členy komise s náplní a cílem diplomové práce. 2. Byly přečteny posudky na diplomovou práci. 3. Studentka akceptovala všechny připomínky oponentky a na všechny otázky odpověděla v plné šíři. Diskuse: prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. Kolik lokalit a jak byly velké dané lokality, kde se vyskytují testované čističky odpadních vod? prof. Ing. Stanislav Obruča, Ph.D. Co bylo náplní Vaší experimentální části? Pokud se dostávají bakterie z čističky odpadních vod do vody, myslíte, že daná čistička funguje dobře? Jaký krok v rámci čistění odpadní vody byste doporučila k odstranění bakterií? doc. Mgr. Václav Brázda, Ph.D. Jaká je variabilita enzymů pro rezistenci proti antibiotikům u testovaných bakteriálních kmenů? Byly sekvenační výsledky daných genů stejné nebo se zde vyskytovala nějaká variabilita? Studentka výborně odpověděla na všechny doplňující otázky členů komise, které byly v průběhu diskuse k dané problematice vzneseny. V diskusi studentka prokázala výbornou orientaci v dané problematice. Po diskusi následovalo hodnocení závěrečné práce. Diplomantka prokázala nejen výborné odborné znalosti, ale i schopnost samostatné prezentace dosažených výsledků. | cs |
| but.jazyk | slovenština (Slovak) | |
| but.program | Chemie a technologie potravin | cs |
| but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
| dc.contributor.advisor | Sukkar,, Iva | sk |
| dc.contributor.author | Kocúrová, Petra | sk |
| dc.contributor.referee | Masaříková,, Martina | sk |
| dc.date.accessioned | 2022-05-28T06:54:24Z | |
| dc.date.available | 2022-05-28T06:54:24Z | |
| dc.date.created | 2022 | cs |
| dc.description.abstract | Rastúci výskyt rezistentných baktérií k antibiotikám predstavuje obrovské riziko pre verejné zdravie. Enterobacter spp. je bežne rozšírená baktéria v životnom prostredí, zároveň je ale dokumentovaná ako častá príčina ochorení človeka. Enterobacter spp. rezistentný k cefalosporínom a karbapenémom je stále častejšie celosvetovo detekovaný ako v nemocničnom prostredí, tak aj mimo neho. Táto diplomová práca skúma výskyt kmeňov Enterobacter spp. rezistentných k –laktámovým antibiotikám, najmä v odpadových vodách, ale aj v prečistených vodách, ktoré sú vypúšťané do životného prostredia. Cieľom práce bolo charakterizovať súbor 205 kmeňov Enterobacter spp. selektovaných na médiu s prídavkom cefotaximu a meropenemu. Vzorky vôd boli odobrané z troch krajských miest v Českej Republike a pochádzali z nemocničnej odpadovej vody, z prítoku a odtoku čističky odpadových vôd (ČOV), z rieky nad ČOV a rieky pod ČOV. Metódou polymerázovej reťazovej reakcie (PCR) bolo v izolátoch hľadaných 8 vybraných génov kódujúcich produkciu širokospektrálnych –laktamáz (ESBL; CTX-M, GES) a karbapenemáz (GES, IMI/NMC-A, IMP, KPC, NDM, OXA-48, VIM). Tiež bol stanovený fenotyp produkcie –laktamáz testom Mastdisc a citlivosti na 24 rôznych antibiotík mikrodilučnou metódou. U izolátov nesúcich hľadaný gén bola vykonaná klonálna analýza metódou restrikčného štiepenia v kombinácii s pulznou gélovou elektroforézou (PFGE). Z celkovo 205 kmeňov nieslo 36 izolátov hľadaný gén pre produkciu –laktamáz. Tieto izoláty pochádzali zväčša z nemocničnej odpadovej vody (n=31) zo všetkých vzorkovaných lokalít A, B a C. Taktiež bol zachytený jeden izolát v prítoku ČOV v lokalite B a štyri izoláty pochádzali z odtoku ČOV v lokalitách A a B. U izolátov boli detekované nasledujúce záujmové gény: blaGES (n=16), blaCTX-M (n=24), blaOXA-48 (n=1) a blaNMC-A (n=1), v ojedinelých prípadoch bola detekovaná kombinácia dvoch génov u jedného izolátu. Všetky charakterizované izoláty (n=36) vykazovali multirezistentný profil. Bola zaznamenaná vysoká rezistencia k aminoglykozidom (76,9 %) s výnimkou amikacínu (19,4 %). V prípade karbapenémov bola pozorovaná rezistencia na ertapeném (77,8 %), naopak veľká časť kmeňov bola citlivá na meropeném, kde rezistencia bola zaznamenaná iba u 13,9 % izolátov. U antibiotík zo skupiny cefalosporínov všetky izoláty vykazovali rezistenciu na antibiotiká cefazolín a cefuroxím (100 %), nižia miera rezistencie bola zaznamenaná u antibiotík cefoperazón (80,6 %), cefotaxím (77,8 %) a cefepím (69,4 %). Najnižšia rezistencia u tejto skupiny antibiotík bola zaznamená u antibiotika cefoperazón/sulbaktám (33,3 %). Všetky vybrané izoláty vykazovali rezistenciu k tetracyklínovým antibiotikám. Fenotypovými testami bola najčastejšie zaznamenaná produkcia serínovej karbapenemázy (50 %), kam sú radené určité varianty –laktamázy GES. Porovnanie makrorestričných profilov poukázalo na vysokú diverzitu medzi izolátmi reprezentovanou 20 rôznymi klastrami, pričom príbuzné izoláty pochádzali vždy z rovnakej lokality. Odpadové vody hrajú kľúčovú rolu v šírení antibiotickej rezistencie. V rámci tejto diplomovej práce boli detekované kmene Enterobacter spp. s klinicky významnou rezistenciou k cefalosporínom a karbapenémom. Tieto kmene boli zachytené najmä v nemocničných odpadových vodách, ale aj na odtoku ČOV, kedy súčasné procesy v ČOV nedokážu eliminovať všetky baktérie, ktoré sa následne dostávajú do životného prostredia. | sk |
| dc.description.abstract | The increasing prevalence of antibiotic–resistant bacteria pose a huge risk for public health. Enterobacter spp. is a common in the environment but it is also documented as a frequent cause of human disease. Enterobacter spp. resistant to cephalosporins and carbapenems is increasingly detected globally both in and out of hospital setting. This thesis examines the occurrence of Enterobacter spp. strains resistant to –lactam antibiotics especially in wastewaters but also in treated water discharged into the environment. The aim of this study was to characterize a set of 205 strains of Enterobacter spp. selected on medium supplemented with cefotaxime and meropenem. The water samples were collected from three regional cities in the Czech Republic and originated from hospital wastewater, inflow and outflow of municipal wastewater treatment plant (WWTP), from a river above and below the WWTP. The isolates were screened for presence of eight genes encoding production of broad–spectrum –lactamases (ESBL; CTX-M, GES) and carbapenemases (GES, IMI/NMC-A, IMP, KPC, NDM, OXA-48, VIM) by the polymerase chain reaction (PCR) method. The phenotype of isolates carrying the gene of interest was tested for –lactamase production by the Mastdisc test and susceptibility to 24 different antibiotics by microdilution method. The phylogenetic relatedness was determined using restriction digestion in combination with pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). From total of 205 strains, 36 isolates carried the gene of interest for –lactamase production. These isolates originated mostly from hospital wastewater (n=31) of all sampled sites (A, B and C). Also one isolate was detected in the WWTP influent in site B and four isolates came from the WWTP effluent in sites A and B. The following genes of interest were detected among the isolates: blaGES (n=16), blaCTX-M (n=24), blaOXA-48 (n=1) and blaNMC-A (n=1) a combination of two genes were detected in one isolate. All characterized isolates (n=36) showed a multidrug–resistant profile. High resistance to aminoglycosides was reported (76,9 %) with the exception of amikacin (19,4 %). In the case of carbapenems, resistance to ertapenem was observed (77,8 %), while a majority of strains were susceptible to meropenem, where resistance was detected only in 13,9 % of cases. Different resistance profile has been reported to cephalosporin antibiotics. All tested isolates showed resistance to antibiotics cefazolin and cefuroxime (100 %), lower rates of resistance were reported to antibiotics cefoperazone (80,6 %), cefotaxime (77,8 %) and cefepime (69,4 %). The lowest resistance in this group of antibiotics was found to cefoperazone/sulbactam (33,3 %). All selected isolates showed resistance to tetracycline antibiotics. Serine carbapenemase production (50 %) was the most frequently detected by phenotypic tests which is produced certain variants of –lactamase GES. Comparison of macrorestrictions profiles showed a high diversity among isolates represented by 20 different clusters, the related isolates originated from the same location. Wastewaters play a key role in the spread of antibiotics resistance. In this thesis, Enterobacter spp. strains with clinically significant resistance to cephalosporins and carbapenems were detected. These strains were detected mainly in hospital wastewaters but also in WWTP effluent. The current WWTP processes are unable to eliminate all bacteria that subsequently enter the environment. | en |
| dc.description.mark | A | cs |
| dc.identifier.citation | KOCÚROVÁ, P. Enterobacter spp. rezistentné k beta-laktamovým antibiotikám z mestských a nemocničných odpadných vôd [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2022. | cs |
| dc.identifier.other | 138753 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/204565 | |
| dc.language.iso | sk | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | Enterobacter spp. | sk |
| dc.subject | antibiotiká | sk |
| dc.subject | rezistencia | sk |
| dc.subject | odpadové vody | sk |
| dc.subject | –laktamázy | sk |
| dc.subject | Enterobacter spp. | en |
| dc.subject | antibiotics | en |
| dc.subject | resistance | en |
| dc.subject | wastewater | en |
| dc.subject | –lactamase | en |
| dc.title | Enterobacter spp. rezistentné k beta-laktamovým antibiotikám z mestských a nemocničných odpadných vôd | sk |
| dc.title.alternative | Enterobacter spp. resistant to beta-lactam antibiotics from urban and hospital wastewater | en |
| dc.type | Text | cs |
| dc.type.driver | masterThesis | en |
| dc.type.evskp | diplomová práce | cs |
| dcterms.dateAccepted | 2022-05-27 | cs |
| dcterms.modified | 2022-05-27-15:13:53 | cs |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta chemická | cs |
| sync.item.dbid | 138753 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2022.05.28 08:54:24 | en |
| sync.item.modts | 2022.05.28 08:14:26 | en |
| thesis.discipline | Potravinářská chemie a biotechnologie | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. Ústav chemie potravin a biotechnologií | cs |
| thesis.level | Inženýrský | cs |
| thesis.name | Ing. | cs |