but.committee	prof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda) prof. RNDr. Alexandr Meduna, CSc. (místopředseda) Ing. Vladimír Bartík, Ph.D. (člen) Ing. Tomáš Martínek, Ph.D. (člen) Ing. William Steingartner, Ph.D. (člen) doc. Ing. František Zbořil, Ph.D. (člen)	cs
but.defence	Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm " A ". Otázky u obhajoby: Na základě jakých parametrů byly vybrány nástroje integrované do jednotlivých kroků algoritmu (Caver pro vyhledání tunelů, CASTp pro detekci kapes atd.)? Nakolik je současná platforma připravena pracovat s jinými rodinami enzymů než jsou haloalkan dehalogenázy? Dovedete odhadnout, nakolik je příprava vstupních dat pro uživatele náročná?	cs
but.jazyk	čeština (Czech)
but.program	Informační technologie	cs
but.result	práce byla úspěšně obhájena	cs
dc.contributor.advisor	Martínek, Tomáš	cs
dc.contributor.author	Hon, Jiří	cs
dc.contributor.referee	Bendl, Jaroslav	cs
dc.date.accessioned	2018-10-21T20:57:40Z
dc.date.available	2018-10-21T20:57:40Z
dc.date.created	2015	cs
dc.description.abstract	Proteinové inženýrství je dynamicky se rozvíjecí obor s velkým množstvím potenciálních aplikací v praxi. Úspěch v tomto oboru je však podmíněn co nejlepším využitím všech dostupných informací o proteinech, k čemuž se využívá množství bioinformatických nástrojů a analýz. Cílem této práce je vytvoření nového nástroje na podporu proteinového inženýrství, který by umožnil vyhledávání příbuzných proteinů s modifikovanou funkcí ve stále rostoucích proteinových databázích. Návrh tohoto nástroje je koncipován jako spojení řady existujících bioinformatických analýz a umožní identifikovat příbuzné proteiny se stejným typem enzymatické funkce, avšak s mírně modifikovanými vlastnostmi, především z hlediska selektivity, reakční rychlosti a stability.	cs
dc.description.abstract	Protein engineering is a young dynamic discipline with great amount of potential practical applications. However, its success is primarily based on perfect knowledge and usage of all existing information about protein function and structure. To achieve that, protein engineering is supported by plenty of bioinformatic tools and analysis. The goal of this project is to create a new tool for protein engineering that would enable researchers to identificate related proteins with modified function in still growing biological databases. The tool is designed as an automated workflow of existing bioinformatic analyses that leads to identification of proteins with the same type of enzymatic function, but with slightly modified properties - primarily in terms of selectivity, reaction speed and stability.	en
dc.description.mark	A	cs
dc.identifier.citation	HON, J. Vyhledávání příbuzných proteinů s modifikovanou funkcí [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2015.	cs
dc.identifier.other	88627	cs
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11012/52238
dc.language.iso	cs	cs
dc.publisher	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií	cs
dc.rights	Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení	cs
dc.subject	vyhledávání příbuzných proteinů	cs
dc.subject	predikce funkce proteinu	cs
dc.subject	bioinformatika	cs
dc.subject	related protein identification	en
dc.subject	protein function prediction	en
dc.subject	bioinformatics	en
dc.title	Vyhledávání příbuzných proteinů s modifikovanou funkcí	cs
dc.title.alternative	Detection of Related Proteins with Modified Function	en
dc.type	Text	cs
dc.type.driver	masterThesis	en
dc.type.evskp	diplomová práce	cs
dcterms.dateAccepted	2015-06-22	cs
dcterms.modified	2020-05-10-16:12:02	cs
eprints.affiliatedInstitution.faculty	Fakulta informačních technologií	cs
sync.item.dbid	88627	en
sync.item.dbtype	ZP	en
sync.item.insts	2021.11.10 14:16:28	en
sync.item.modts	2021.11.10 13:31:47	en
thesis.discipline	Bioinformatika a biocomputing	cs
thesis.grantor	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav počítačových systémů	cs
thesis.level	Inženýrský	cs
thesis.name	Ing.	cs

Vyhledávání příbuzných proteinů s modifikovanou funkcí

Files

Original bundle

Collections