Fourierova transformace a spektrogramy v analýze DNA sekvencí

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Jiří Jan, CSc. (předseda) prof. Ing. Valentýna Provazník, Ph.D. (místopředseda) prof. MUDr.Ing. Petr Hluštík, Ph.D. (člen) Dr. Ing. Vlastimil Vondra (člen) Ing. Zenon Starčuk, CSc. (člen) MUDr. Lenka Forýtková, CSc. (člen)cs
but.defenceNa otázku oponenta diplomové práce prof. Provazníka (automatická analýza dat) student přehledně odpověděl a navrhnul možný postup. Ing. Starčuk požádal o objasnění použitého kódování, které student vysvětlil. Celkově student odpovídal velice uspokojivě.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programElektrotechnika, elektronika, komunikační a řídicí technikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorMaděránková, Denisacs
dc.contributor.authorKrejčí, Michalcs
dc.contributor.refereeProvazník, Valentýnacs
dc.date.created2011cs
dc.description.abstractV této diplomové práci jsou v teoretické části popsány metody úprav DNA sekvencí pro frekvenční analýzu a základní vlastnosti DNA. Využitím krátkodobé Fourierovy transformace jsou vytvořeny barevné spektrogramy, pomocí kterých můžeme rozpoznávat některé charakteristické vzory v DNA. V praktické části práce je popsán program sloužící k vytvoření spektrogramů a k následné analýze. Dále je vytvořena analýza vybraných úseků genomu C. elegans. Nalezené vzory jsou porovnány s daty z databáze NCBI. Je zde poukázáno na vztah vytvořených spektrogramů a oblastí kódujících proteiny. Jsou zde uvedeny spektrogramy dobře rozeznatelných vzorů tvořených tandemovými repeticemi složenými ze satelitů, mikrosatelitů a minisatelitů.cs
dc.description.abstractVarious methods of DNA sequences modifications for frequency analysis and basic characteristics of DNA are described in the theoretical part of this thesis. Tricolor spectrograms, created by short time Fourier transform help us to recognize some characteristic patterns in DNA sequences. Practical part of this work deals with developed programme which generates spectrograms and analyse them. Last part deals with the analysis of selected sequences of C. elegans genome. Some patterns are related to data of public databases such as NCBI. Various patterns are explained from the biological nature, which relates to chromosome structure and protein coding regions. Another well recognised patterns, tandem repetitions composed of satellites, microsatellites and minisatelites are described by spectrograms as well.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationKREJČÍ, M. Fourierova transformace a spektrogramy v analýze DNA sekvencí [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2011.cs
dc.identifier.other34209cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/43
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectFourierova transformacecs
dc.subjectspektrogramcs
dc.subjectanalýza DNA sekvencícs
dc.subjectfrekvenční analýzacs
dc.subjectFourier transformen
dc.subjectspectrogramen
dc.subjectanalysis of DNA sequencesen
dc.subjectfrequency-domain analysisen
dc.titleFourierova transformace a spektrogramy v analýze DNA sekvencícs
dc.title.alternativeFourier transformation and spectrogram analysis of DNA sequencesen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2011-06-08cs
dcterms.modified2011-06-14-14:56:10cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid34209en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.26 11:27:12en
sync.item.modts2025.01.17 14:59:59en
thesis.disciplineBiomedicínské a ekologické inženýrstvícs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
4.56 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.rar
Size:
6.53 MB
Format:
Unknown data format
Description:
appendix-1.rar
Download
Thumbnail Image
Name:
review_34209.html
Size:
7.55 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_34209.html
Download
Collections
2011