KREJČÍ, M. Fourierova transformace a spektrogramy v analýze DNA sekvencí [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2011.
Z formálního hlediska je práce na velmi dobré úrovni s malým množstvím gramatických chyb. Po obsahové stránce je práce také kvalitní. Student nastudoval problematiku genomiky, jak z hlediska biologie, tak i možnosti použití diskrétní Fourierovy transformace pro zpracování genomických dat. Biologická část teoretického úvodu je však poněkud vágní, student věnoval více pozornosti technické části práce, kde projevil značnou míru samostatnosti a invence. Student vytvořil funkční program, který umožňuje tvorbu spektrogramů ze sekvencí DNA přes pohodlné grafické uživatelské rozhraní. Program obsahuje množství komponent a jeho funkce je dobře vysvětlena na blokových schématech. Program byl vyzkoušen na stejných datech, na kterých prezentovala výsledky podobné aplikace zahraniční skupina vědců, z jejichž odborných publikací student čerpal. Student dospěl k velice podobným výsledkům. Program by mohl najít uplatnění ve výuce i v další výzkumné činnosti.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Využití literatury | A | 10/10 | |
| Formální zpracování práce | A | 18/20 | |
| Aktivita během řešení a zpracování práce (práce s literaturou, využívání konzultací, atd.) | A | 18/20 | |
| Splnění zadání | A | 48/50 |
Student Michal Krejčí se věnoval oblasti deterministického zpracování a analýzy DNA s využitím Fourierovy transformace. Podle zadání se zaměřil na tvorbu aplikace pro výpočet spektrogramů numerické reprezentace DNA a její implementaci do grafického uživatelského prostředí. V teoretickém rozboru věnovaném biologické podstatě problému je podrobně popsána potřebná část genetiky a molekulární biologie. Text však není příliš přehledný, autor často přechází z tématu na jiné téma a některé formulace jsou nepřesné až zavádějící. Následný teoretický rozbor (technická část) popisuje základ Fourierovy transformace a numerické reprezentace DNA. Rovněž zde je řada nepřesností (např. str. 25 - "vektor indikuje přítomnost (log 0) dané báze" není patrné, proč jsou proměnné nazývány vektory a co je to "log 0"). Některé pojmy se vyskytují bez vysvětlení (např. "binární reprezentace 4D"). Následující kapitola popisu použité metody. Zde autor zvolil ne příliš vhodný postup spočívající v detailním rozboru vytvořeného programu, je ale doplněná vývojovými diagramy, které umožňují pochopit, jak jsou data zpracována a analyzována. U diplomové práce by bylo vhodnější nejprve popsat zvolené metody a teprve poté uvést způsob jejich realizace. Diskuse získaných výsledků v 5. kapitole je dostatečná a akceptovatelná. Vlastní práci lze vytknout některé formální chyby. Například nadpisy kapitol včetně jejich seznamu v obsahu nevhodně zahrnují odkazy na literaturu. Práce má přes uvedené výhrady svoji hodnotu a dosažené výsledky jsou zajímavé a akceptovatelné. Student splnil zadání a dosáhl vytčených cílů. Práci doporučuji k obhajobě a hodnotím známkou B.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | 19/20 | |
| Formální zpracování práce | E | 5/10 | |
| Interpretace výsledků a jejich diskuse | A | 18/20 | |
| Odborná úroveň práce | B | 40/50 |
eVSKP id 34209