The Isolation of DNA by Polycharged Magnetic Particles: An Analysis of the Interaction by Zeta Potential and Particle Size

Simple item page
dc.contributor.authorHaddad, Yazan Abdulmajeed Eyadhcs
dc.contributor.authorXhaxhiu, Kledics
dc.contributor.authorKopel, Pavelcs
dc.contributor.authorHynek, Davidcs
dc.contributor.authorZítka, Ondřejcs
dc.contributor.authorAdam, Vojtěchcs
dc.coverage.issue4cs
dc.coverage.volume17cs
dc.date.accessioned2020-08-04T11:04:06Z
dc.date.available2020-08-04T11:04:06Z
dc.date.issued2016-04-20cs
dc.description.abstractMagnetic isolation of biological targets is in major demand in the biotechnology industry today. This study considers the interaction of four surface-modified magnetic micro- and nanoparticles with selected DNA fragments. Different surface modifications of nanomaghemite precursors were investigated: MAN37 (silica-coated), MAN127 (polyvinylpyrrolidone-coated), MAN158 (phosphate-coated), and MAN164 (tripolyphosphate-coated). All particles were positive polycharged agglomerated monodispersed systems. Mean particle sizes were 0.48, 2.97, 2.93, and 3.67 m for MAN37, MAN127, MAN164, and MAN158, respectively. DNA fragments exhibited negative zeta potential of 0.22 mV under binding conditions (high ionic strength, low pH, and dehydration). A decrease in zeta potential of particles upon exposure to DNA was observed with exception of MAN158 particles. The measured particle size of MAN164 particles increased by nearly twofold upon exposure to DNA. Quantitative PCR isolation of DNA with a high retrieval rate was observed by magnetic particles MAN127 and MAN164. Interaction between polycharged magnetic particles and DNA is mediated by various binding mechanisms such as hydrophobic and electrostatic interactions. Future development of DNA isolation technology requires an understanding of the physical and biochemical conditions of this process.en
dc.description.abstractMagnetická izolacebiologických cílů je hlavní poptávka v dnešním biotechnologickém průmyslu. Tato studie se zabývá interakceí čtyř povrchově upravených magnetických micr a nano částic s vybranými DNA fragmenty. Různé povrchové úpravy prekuzorů nanomaghemite byly zkoumány: MAN37 (křemen potažené), MAN127 (polyvinylpyrrolidon potažené), MAN158 (fosfát potažené) a MAN164 (tripolyfosforečnan potažené). Všechny částice byly pozitivní polynabité glomerované monodispersed systémy. Velikosti částic byli 0,48, 2,97, 2,93, a 3.67 m MAN37, MAN127, MAN164 a MAN158. DNA fragmenty vykazovaly negativní zeta potenciál 0,22 mV za závazné podmínky (vysoká Iontová síla, nízké pH adehydratace). Pokles částic zeta potenciálu při expozici DNA byly sledovány s výjimkou částic MAN158. Velikost měřených částic MAN164 se zvýšil o téměř dvojnásobek po expozici DNA. Budoucí vývoj technologií izolace DNA vyžaduje pochopení fyzikálních a biochemických podmínek v tomto procesucs
dc.formattextcs
dc.format.extent550-1-550-11cs
dc.format.mimetypeapplication/pdfcs
dc.identifier.citationInternational Journal of Molecular Sciences. 2016, vol. 17, issue 4, p. 550-1-550-11.en
dc.identifier.doi10.3390/ijms17040550cs
dc.identifier.issn1422-0067cs
dc.identifier.other126823cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/63814
dc.language.isoencs
dc.publisherMDPIcs
dc.relation.ispartofInternational Journal of Molecular Sciencescs
dc.relation.urihttp://www.mdpi.com/1422-0067/17/4/550cs
dc.rightsCreative Commons Attribution 4.0 Internationalcs
dc.rights.accessopenAccesscs
dc.rights.sherpahttp://www.sherpa.ac.uk/romeo/issn/1422-0067/cs
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/cs
dc.subjectmagnetické
dc.subjectnanočástice
dc.subjectIzolace DNA
dc.subjectZeta potenciál
dc.subjectvelikost částic
dc.subjectmagneticen
dc.subjectnanoparticlesen
dc.subjectDNA isolationen
dc.subjectzeta potentialen
dc.subjectparticle sizeen
dc.titleThe Isolation of DNA by Polycharged Magnetic Particles: An Analysis of the Interaction by Zeta Potential and Particle Sizeen
dc.title.alternativeIzolace DNA pomocí magnetizovatelných částic: Interakční analýza na základě zeta potenciálu a velikosti částiccs
dc.type.driverarticleen
dc.type.statusPeer-revieweden
dc.type.versionpublishedVersionen
sync.item.dbidVAV-126823en
sync.item.dbtypeVAVen
sync.item.insts2020.08.04 13:04:06en
sync.item.modts2020.08.04 12:35:00en
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Středoevropský technologický institut VUT. Chytré nanonástrojecs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 1 of 1
Thumbnail Image
Name:
ijms1700550.pdf
Size:
1015.04 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
ijms1700550.pdf
Download
Collections
Chytré nanonástroje