Genová regulace v Clostridium beijerinckii NRRL B-598

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda) Ing. Jan Odstrčilík, Ph.D. (místopředseda) doc. Mgr. Ing. Karel Sedlář, Ph.D. (člen) doc. RNDr. Michal Masařík, Ph.D. (člen) Ing. Vratislav Čmiel, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Odstrčilík položil otázku: v jakém rozmezí jsou uvedeny vypočítané korelace. Dále položil doplňující otázku, jak musí být velká hodnota korelace, aby bylo určeno, že se mezi dvěma geny nachází hrana. Doc. Kolář položil otázku, proč v porovnání korelace s vzájemnou informací vyšly vyšší hodnoty pro korelaci, než pro vzájemnou informaci. Dále položil doplňující otázku, zda existují i jiné bakterie produkující butanol. Doc. Masařík položil otázku, proč si studentka vybrala právě organismus C. beijerinckii NRRL B-598 a jaké případné praktické využití má tento organismus. Ing. Čmiel položil otázku, jak konkrétně studentka využívala infrastrukturu Metacentrum. Student obhájil diplomovou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykangličtina (English)
but.programBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorSedlář, Karelen
dc.contributor.authorSchwarzerová, Janaen
dc.contributor.refereeŠabatová, Kateřinaen
dc.date.created2020cs
dc.description.abstractDiplomová práce se zabývá studiem genové regulace v Clostridium beijerinckii NRRL B-598, pro následné odvození genové regulační sítě bakterie C. beijerinckii NRRL B-598. V teoretické části této práce je uvedena obecná nomenklatura problematiky genové regulace se zaměřením na nomenklaturu genových regulačních sítí. Následně jsou zde popsané laboratorní metody, sloužící pro získání vhodných dat popisující expresi genů. Tato data jsou základem pro studium genové regulace a návrhy genových regulačních sítí. Práce se zaměřuje především na technologii RNA-Seq a stručný popis laboratorních dat získaných ze zmíněné bakterie C. beijerinckii NRRL B-598. V praktické části se práce zabývá předzpracováním těchto surových laboratorních dat a následným studiem genové regulace se zaměřením na odvození operonů a vytvoření prvních genových regulačních sítí pomocí různých přístupů pro C. beijerinckii NRRL B-598.en
dc.description.abstractThe master’s thesis deals with the study of gene regulatory in Clostridium beijerinckii NRRL B-598 for inference gene regulatory network for C. beijerinckii NRRL B-598. The theoretic part describes basic nomenclature gene regulatory with the main focus on gene regulatory networks nomenclature. Laboratory methods which serve to obtain suitable gene describing express data are described there. These data are based on the study of gene regulatory and inference gene regulatory networks. The thesis is mainly focused on the RNA-Seq technology and brief description of laboratory data which were gathered using the strain C. beijerinckii NRRL B-598. In the practical part of the thesis pre-processing of these raw laboratory data and following gene regulatory research is performed which focuses on inference operons and creating first gene regulatory networks for C. beijerinckii NRRL B-598 using different approaches.cs
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationSCHWARZEROVÁ, J. Genová regulace v Clostridium beijerinckii NRRL B-598 [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2020.cs
dc.identifier.other126847cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/189155
dc.language.isoencs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectGenová regulaceen
dc.subjectGenová regulační síťen
dc.subjectClostridium beijerinckiien
dc.subjectRNA-Seqen
dc.subjectTranskriptomen
dc.subjectGene regulatorycs
dc.subjectGene regulatory networkcs
dc.subjectClostridium beijerinckiics
dc.subjectRNA-Seqcs
dc.subjectTranscriptomecs
dc.titleGenová regulace v Clostridium beijerinckii NRRL B-598en
dc.title.alternativeGene regulation in Clostridium beijerinckii NRRL B-598cs
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2020-06-16cs
dcterms.modified2020-06-19-13:01:40cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid126847en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.26 14:22:58en
sync.item.modts2025.01.17 14:13:47en
thesis.disciplinebez specializacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
4.33 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
13.92 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_126847.html
Size:
6.27 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_126847.html
Download
Collections
2020