Segmentace biologických vzorků v obrazech z kryo-elektronového mikroskopu s využitím metod strojového učení
| but.committee | doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (předseda) Ing. Roman Jakubíček, Ph.D. (místopředseda) Ing. Vratislav Čmiel, Ph.D. (člen) Ing. Vratislav Harabiš, Ph.D. (člen) MUDr. Zuzana Nováková, Ph.D. (člen) | cs |
| but.defence | Student prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Doc. Kolářová sa dotázala na vlastnosť obrazu, ktorá by mohla pomocť k rozpoznať ľadové kryštály a či je možné využiť inú zobrazovaciu modalitu; Ing. Jakubíček sa dotázal na důvod odstrániť "skip connections" v použitom modele; ako boli urobené anotácie; boli anotácie konzultované s expertmi?. Student obhájil diplomovou práci s výhradami a odpověděl na otázky členů komise a oponenta. | cs |
| but.jazyk | angličtina (English) | |
| but.program | Biomedicínské inženýrství a bioinformatika | cs |
| but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
| dc.contributor.advisor | Chmelík, Jiří | en |
| dc.contributor.author | Sokol, Norbert | en |
| dc.contributor.referee | Vičar, Tomáš | en |
| dc.date.created | 2021 | cs |
| dc.description.abstract | Zobrazovanie pomocou kryo-elektrónovej mikroskopie má svoje nezastúpiteľné miesto v analýze viacerých biologických štruktúr. Lokalizácia buniek kultivovaných na mriežke a ich segmentácia voči pozadiu alebo kontaminácii je základom. Spolu s vývojom viacerých metód hlbokého učenia sa podstatne zvýšila úspešnosť úloh sémantickej segmentácie. V tejto práci vyvinieme hlbokú konvolučnú neurónovú sieť pre úlohu sémantickej segmentácie buniek kultivovaných na mriežke. Dátový súbor pre túto prácu bol vytvorený pomocou dual-beam kryo-elektónového mikroskopu vyvinutého spoločnosťou Thermo Fisher Scientific Brno. | en |
| dc.description.abstract | Cryo-electron microscopy imaging has its irreplaceable position in analysis of various biological structures. Localization of the cells cultivated on grid and their segmentation towards background or contamination is essential. With the development of various deep learning methods, the performance of semantic segmentation tasks dramatically increased. In this thesis, we will develop a deep convolutional neural network for semantic segmentation of the cells cultivated on grid. Dataset for this thesis was created with dual-beam cryo-electron microscope developed by Thermo Fisher Scientific Brno. | cs |
| dc.description.mark | C | cs |
| dc.identifier.citation | SOKOL, N. Segmentace biologických vzorků v obrazech z kryo-elektronového mikroskopu s využitím metod strojového učení [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2021. | cs |
| dc.identifier.other | 134411 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/197108 | |
| dc.language.iso | en | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | kryo-elektrónová mikroskopia | en |
| dc.subject | preparácia vzorku na mriežke | en |
| dc.subject | hlboké učenie | en |
| dc.subject | strojové učenie | en |
| dc.subject | konvolučné neurónové siete | en |
| dc.subject | sémantická segmentácia. | en |
| dc.subject | cryo-electron microscopy | cs |
| dc.subject | grid sample preparation | cs |
| dc.subject | deep learning | cs |
| dc.subject | machine learning | cs |
| dc.subject | convolutional neural networks | cs |
| dc.subject | semantic segmentation. | cs |
| dc.title | Segmentace biologických vzorků v obrazech z kryo-elektronového mikroskopu s využitím metod strojového učení | en |
| dc.title.alternative | Segmentation of biological samples in cryo-electron microscopy images using machine learning methods | cs |
| dc.type | Text | cs |
| dc.type.driver | masterThesis | en |
| dc.type.evskp | diplomová práce | cs |
| dcterms.dateAccepted | 2021-06-10 | cs |
| dcterms.modified | 2021-06-10-13:53:46 | cs |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií | cs |
| sync.item.dbid | 134411 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2025.03.26 14:28:44 | en |
| sync.item.modts | 2025.01.15 19:53:07 | en |
| thesis.discipline | bez specializace | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrství | cs |
| thesis.level | Inženýrský | cs |
| thesis.name | Ing. | cs |
Files
Original bundle
1 - 3 of 3
Loading...
- Name:
- final-thesis.pdf
- Size:
- 15.06 MB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- final-thesis.pdf
Loading...
- Name:
- review_134411.html
- Size:
- 7.48 KB
- Format:
- Hypertext Markup Language
- Description:
- file review_134411.html