Studium populace bakterií pomocí metod obrazové analýzy

but.committeeprof. Ing. Miloslav Pekař, CSc. (předseda) prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (místopředseda) prof. Ing. Oldřich Zmeškal, CSc. (člen) prof. Ing. Michal Veselý, CSc. (člen) doc. Ing. Pavel Diviš, Ph.D. (člen)cs
but.defenceMárová – terminologie,cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programChemie a chemické technologiecs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorZmeškal, Oldřichcs
dc.contributor.authorŠevčík, Jancs
dc.contributor.refereeVeselá, Máriacs
dc.date.created2015cs
dc.description.abstractBakalářská práce je zaměřena na sledování a uplatnění metod obrazové analýzy na bakteriích druhu Bacillus megaterium a Cupriavidus necator. V úvodu práce jsou popsány obecné znalosti o bakteriích, mikroskopických metodách a metodách obrazové analýzy. K pozorování buněk bakterií, bylo nutné nejprve připravit vhodné mikroskopické preparáty pomocí metody Gramova barvení. Obrazy jednotlivých snímků bakterií byly zaznamenány pomocí CCD kamery a mikroskopu a potom analyzovány. Nejprve byla metodou Box–Counting zjištěna optimální hodnota prahu a jí odpovídající fraktální míry (resp. plochy pokryté bakteriemi) a fraktální dimenze (resp. entropie jejich uspořádání na ploše). Prahované obrázky byly dále zpracovány pomocí metody Mass–Radius, která umožnila zjistit distribuci bakterií vzhledem k těžišti jejich shluku.cs
dc.description.abstractThis bachelor thesis is focused on monitoring and application of image analysis methods on Bacillus megaterium and Cupriavidus necator bacteria. The introduction describes a general knowledge about bacteria, microscopic and image analysis methods. At first it was necessary to prepare suitable microscopic specimens using Gram staining for the observation of a bacteria cell. Every picture of bacteria was taken using a CCD camera and a microscope. Box–Counting method was used to identify the optimal threshold value, corresponding to their fractal measure (or surface areas covered with bacteria) and fractal dimension (or entropy of their arrangement on the surface area). After thresholding, the images were further processed using the Mass–Radius method, which defines a distribution of bacteria relative to the centroid of a cluster.en
dc.description.markCcs
dc.identifier.citationŠEVČÍK, J. Studium populace bakterií pomocí metod obrazové analýzy [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2015.cs
dc.identifier.other70295cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/31458
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta chemickács
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectBacillus megateriumcs
dc.subjectCupriavidus necatorcs
dc.subjectobrazová analýzacs
dc.subjectfraktální analýzacs
dc.subjectprahovánícs
dc.subjectBox–Counting metodacs
dc.subjectMass–Radius metodacs
dc.subjectBacillus megateriumen
dc.subjectCupriavidus necatoren
dc.subjectimage analysisen
dc.subjectfractal analysisen
dc.subjectthresholdingen
dc.subjectBox–Counting methoden
dc.subjectMass–Radius methoden
dc.titleStudium populace bakterií pomocí metod obrazové analýzycs
dc.title.alternativeStudy population of bacteria by image analysis methodsen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2015-06-18cs
dcterms.modified2015-06-19-18:57:59cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta chemickács
sync.item.dbid70295en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.16 12:48:22en
sync.item.modts2025.01.15 20:26:55en
thesis.disciplineChemie pro medicínské aplikacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. Ústav fyzikální a spotřební chemiecs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 2 of 2
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
2.86 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
review_70295.html
Size:
4.49 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_70295.html
Collections