Biotechnologické produkce polyhydroxyalkanoátů svyužitím extrémofilních purpurových bakterií
Loading...
Date
Authors
Rubanová, Blanka
ORCID
Advisor
Referee
Mark
A
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická
Abstract
Předložená diplomová práce se zabývá studiem metabolismu polyhydroxyalkanoátů (PHA) u extrémofilních purpurových bakterií, konktrétně bakterií Rhodoblastus acidophilus a Rhodobaca barguzinensis. Schopnost bakterií syntetizovat PHA byla zkoumaná při kultivaci v různých médiích a při využití různých zdrojů uhlíku. Nejprve byly určeny nejvhodnější podmínky (objem média, přítomnost světla, doba kultivace) pro kultivaci inokula. Následně byl pomocí plynové chromatografie zkoumán obsah PHA v bakteriích kultivovaných v různých médiích a za přídavku různých zdrojů uhlíku. Pro lepší charakterizaci metabolismu a morfologie bakterií byly dále použity metody skenovací transmisní elektronové mikroskopie (STEM) a infračervená spektroskopie s Fourierovou transformací (FTIR). Schopnost bakterií syntetizovat PHA byla zkoumána i na úrovni genotypu, a to metodou polymerázové řetězové reakce (PCR). V bakteriální DNA byla detekována přítomnost genu phaC, který kóduje PHA syntázu I. třídy. Dále byl proveden experiment, při kterém byly bakterie kultivovány v podmínkách příznivých pro syntézu mikrobiálních pigmentů (karotenoidy a bakteriochlorofyl a). Absorpční spektrum extrahovaných pigmentů bylo měřeno pomocí UV-VIS spektroskopie.
The presented thesis focuses on studying the metabolism of polyhydroxyalkanoates (PHAs) in extremophilic purple bacteria, specifically Rhodoblastus acidophilus and Rhodobaca barguzinensis. The bacteria's ability to synthesize PHAs was examined in various media and using different carbon sources. Initially, optimal conditions including media volume, light presence, cultivation duration, and inoculum size were determined for the most suitable bacterial growth. Subsequently, the PHA content in bacteria cultivated in different media and with various carbon sources was analysed using gas chromatography. For a better characterization of bacterial metabolism and morphology, scanning transmission electron microscopy (STEM) and Fourier-transform infrared spectroscopy (FTIR) were used. The bacteria's ability to synthesize PHA was also examined at the genotype level using polymerase chain reaction (PCR) method. The presence of the phaC gene, encoding PHA synthase class I, was detected in bacterial DNA. Additionally, an experiment was conducted to cultivate bacteria under conditions favourable for the synthesis of microbial pigments (carotenoids and bacteriochlorophyll a). The absorption spectrum of extracted pigments was measured using UV-VIS spectroscopy.
The presented thesis focuses on studying the metabolism of polyhydroxyalkanoates (PHAs) in extremophilic purple bacteria, specifically Rhodoblastus acidophilus and Rhodobaca barguzinensis. The bacteria's ability to synthesize PHAs was examined in various media and using different carbon sources. Initially, optimal conditions including media volume, light presence, cultivation duration, and inoculum size were determined for the most suitable bacterial growth. Subsequently, the PHA content in bacteria cultivated in different media and with various carbon sources was analysed using gas chromatography. For a better characterization of bacterial metabolism and morphology, scanning transmission electron microscopy (STEM) and Fourier-transform infrared spectroscopy (FTIR) were used. The bacteria's ability to synthesize PHA was also examined at the genotype level using polymerase chain reaction (PCR) method. The presence of the phaC gene, encoding PHA synthase class I, was detected in bacterial DNA. Additionally, an experiment was conducted to cultivate bacteria under conditions favourable for the synthesis of microbial pigments (carotenoids and bacteriochlorophyll a). The absorption spectrum of extracted pigments was measured using UV-VIS spectroscopy.
Description
Keywords
Citation
RUBANOVÁ, B. Biotechnologické produkce polyhydroxyalkanoátů svyužitím extrémofilních purpurových bakterií [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2024.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
bez specializace
Comittee
prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (předseda)
prof. Ing. Stanislav Obruča, Ph.D. (místopředseda)
doc. Ing. Pavel Diviš, Ph.D. (člen)
prof. Mgr. Václav Brázda, Ph.D. (člen)
doc. RNDr. Renata Mikulíková, Ph.D. (člen)
doc. Ing. Eva Vítová, Ph.D. (člen)
prof. Ing. Stanislav Kráčmar, DrSc. (člen)
Date of acceptance
2024-05-24
Defence
1. Studentka seznámila členy komise s náplní a cílem diplomové práce.
2. Byly přečteny posudky na diplomovou práci.
3. Studentka akceptovala všechny připomínky oponenta a na všechny otázky odpověděla v plné šíři.
Diskuse:
prof. RNDr. Ivana Márová, CSc.
Byly Vámi zkoumané kultury zbarvené? Bylo možné pigment kvantitativně stanovit? Produkují dané bakterie bakteriální chlorofyl? Za jakých podmínek jsou bakterie schopny ho produkovat?
V rámci stanovení růstových křivek daných kmenů uvádíte rozdílnou dobu kultivace, mohla byste to objasnit? Jak byl prováděn anaerobní růst bakterií?
prof. Mgr. Václav Brázda, Ph.D.
Kde se bakterie, kterým jste se věnovala v práci, přirozeně vyskytují?
Jsou známy genomy těchto bakterií? Obsahovaly geny pro phaC syntázu? Jak jste navrhovala primery?
Studentka odpověděla na všechny doplňující otázky členů komise, které byly v průběhu diskuse k dané problematice vzneseny. V diskusi studentka prokázala výbornou orientaci v dané problematice. Po diskusi následovalo hodnocení závěrečné práce. Diplomantka prokázala nejen výborné odborné znalosti, ale i schopnost samostatné prezentace dosažených výsledků.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení