Optimalizace algoritmu pro detekci G-kvadruplexů

but.committeeprof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda) doc. Ing. František Zbořil, CSc. (místopředseda) RNDr. Petr Fuchs, Ph.D. (člen) Ing. Zbyněk Křivka, Ph.D. (člen) doc. Ing. Tomáš Martínek, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka nejprve prezentovala výsledky, kterých dosáhla v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Studentka následně odpověděla na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studentky na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm výborně (A) . Otázky u obhajoby: V práci ohodnocujete dopad obou optimalizací (omezení počtu rekurzivního volání a náhradu funkce exp) na výkonnost nástroje, přičemž obě techniky aplikujete současně. Jaký by byl efekt těchto optimalizací aplikovaných samostatně? Na obrázku 4.5 ukazujete určitou anomálii ve výkonnosti programu v závislosti na obsahu G ve vstupní sekvenci. Dokázala byste ji zdůvodnit?cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programInformační technologiecs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorHon, Jiřícs
dc.contributor.authorLabudová, Dominikacs
dc.contributor.refereeMartínek, Tomášcs
dc.date.created2019cs
dc.description.abstractDetekcia G-kvadruplexov v DNA bola v posledných rokoch cieľom viacerých štúdií. Dôsledkom bol vznik viacerých identifikačných nástrojov. Táto bakalárska práca sa zameriava na analýzu a optimalizáciu nástroja pqsfinder ako aj vytvorenie užívateľského rozhrania pre tento nástroj. Optimalizácia poskytla významný nárast v rýchlosti algoritmu a taktiež jeho schopnosti spracovávať dlhé DNA sekvencie. Užívateľské rozhranie bolo navrhnuté a implementované za použitia moderných a efektívnych technológií s dôrazom na užívateľskú prívetivosť webovej aplikácie.cs
dc.description.abstractIdentification of G-quadruplexes in DNA has been the interest of many studies  in recent years. As a result, many identification tools were created. This bachelor's thesis focuses on analysis and optimization of a tool called pqsfinder along with creating a web interface for this tool. The optimization provided significant increase in the algorithm's speed and ability to process long DNA sequences. The web interface was designed and implemented using modern and effective technologies with emphasis on the user friendliness of the web application.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationLABUDOVÁ, D. Optimalizace algoritmu pro detekci G-kvadruplexů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2019.cs
dc.identifier.other121879cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/180107
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectDNAcs
dc.subjectG-kvadruplexcs
dc.subjectanalýzacs
dc.subjectoptimalizáciacs
dc.subjectwebová aplikáciacs
dc.subjectGUIcs
dc.subjectReactcs
dc.subjectDNAen
dc.subjectG-quadruplexen
dc.subjectanalysisen
dc.subjectoptimizationen
dc.subjectweb applicationen
dc.subjectGUIen
dc.subjectReacten
dc.titleOptimalizace algoritmu pro detekci G-kvadruplexůcs
dc.title.alternativeOptimization of G-Quadruplex Identification Algorithmen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2019-06-13cs
dcterms.modified2019-07-08-13:31:16cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta informačních technologiícs
sync.item.dbid121879en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.18 19:09:44en
sync.item.modts2025.01.17 11:32:08en
thesis.disciplineInformační technologiecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav informačních systémůcs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 4 of 4
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
3.03 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Vedouci prace-20792_v.pdf
Size:
86.63 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek-Vedouci prace-20792_v.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Oponent prace-20792_o.pdf
Size:
88.5 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek-Oponent prace-20792_o.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
review_121879.html
Size:
1.44 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_121879.html
Collections