Optimalizace algoritmu pro detekci G-kvadruplexů
but.committee | prof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda) doc. Ing. František Zbořil, CSc. (místopředseda) RNDr. Petr Fuchs, Ph.D. (člen) Ing. Zbyněk Křivka, Ph.D. (člen) doc. Ing. Tomáš Martínek, Ph.D. (člen) | cs |
but.defence | Studentka nejprve prezentovala výsledky, kterých dosáhla v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Studentka následně odpověděla na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studentky na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm výborně (A) . Otázky u obhajoby: V práci ohodnocujete dopad obou optimalizací (omezení počtu rekurzivního volání a náhradu funkce exp) na výkonnost nástroje, přičemž obě techniky aplikujete současně. Jaký by byl efekt těchto optimalizací aplikovaných samostatně? Na obrázku 4.5 ukazujete určitou anomálii ve výkonnosti programu v závislosti na obsahu G ve vstupní sekvenci. Dokázala byste ji zdůvodnit? | cs |
but.jazyk | čeština (Czech) | |
but.program | Informační technologie | cs |
but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
dc.contributor.advisor | Hon, Jiří | cs |
dc.contributor.author | Labudová, Dominika | cs |
dc.contributor.referee | Martínek, Tomáš | cs |
dc.date.created | 2019 | cs |
dc.description.abstract | Detekcia G-kvadruplexov v DNA bola v posledných rokoch cieľom viacerých štúdií. Dôsledkom bol vznik viacerých identifikačných nástrojov. Táto bakalárska práca sa zameriava na analýzu a optimalizáciu nástroja pqsfinder ako aj vytvorenie užívateľského rozhrania pre tento nástroj. Optimalizácia poskytla významný nárast v rýchlosti algoritmu a taktiež jeho schopnosti spracovávať dlhé DNA sekvencie. Užívateľské rozhranie bolo navrhnuté a implementované za použitia moderných a efektívnych technológií s dôrazom na užívateľskú prívetivosť webovej aplikácie. | cs |
dc.description.abstract | Identification of G-quadruplexes in DNA has been the interest of many studies in recent years. As a result, many identification tools were created. This bachelor's thesis focuses on analysis and optimization of a tool called pqsfinder along with creating a web interface for this tool. The optimization provided significant increase in the algorithm's speed and ability to process long DNA sequences. The web interface was designed and implemented using modern and effective technologies with emphasis on the user friendliness of the web application. | en |
dc.description.mark | A | cs |
dc.identifier.citation | LABUDOVÁ, D. Optimalizace algoritmu pro detekci G-kvadruplexů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2019. | cs |
dc.identifier.other | 121879 | cs |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/180107 | |
dc.language.iso | cs | cs |
dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií | cs |
dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
dc.subject | DNA | cs |
dc.subject | G-kvadruplex | cs |
dc.subject | analýza | cs |
dc.subject | optimalizácia | cs |
dc.subject | webová aplikácia | cs |
dc.subject | GUI | cs |
dc.subject | React | cs |
dc.subject | DNA | en |
dc.subject | G-quadruplex | en |
dc.subject | analysis | en |
dc.subject | optimization | en |
dc.subject | web application | en |
dc.subject | GUI | en |
dc.subject | React | en |
dc.title | Optimalizace algoritmu pro detekci G-kvadruplexů | cs |
dc.title.alternative | Optimization of G-Quadruplex Identification Algorithm | en |
dc.type | Text | cs |
dc.type.driver | bachelorThesis | en |
dc.type.evskp | bakalářská práce | cs |
dcterms.dateAccepted | 2019-06-13 | cs |
dcterms.modified | 2019-07-08-13:31:16 | cs |
eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta informačních technologií | cs |
sync.item.dbid | 121879 | en |
sync.item.dbtype | ZP | en |
sync.item.insts | 2025.03.18 19:09:44 | en |
sync.item.modts | 2025.01.17 11:32:08 | en |
thesis.discipline | Informační technologie | cs |
thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav informačních systémů | cs |
thesis.level | Bakalářský | cs |
thesis.name | Bc. | cs |
Files
Original bundle
1 - 4 of 4
Loading...
- Name:
- final-thesis.pdf
- Size:
- 3.03 MB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- final-thesis.pdf
Loading...
- Name:
- Posudek-Vedouci prace-20792_v.pdf
- Size:
- 86.63 KB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- Posudek-Vedouci prace-20792_v.pdf
Loading...
- Name:
- Posudek-Oponent prace-20792_o.pdf
- Size:
- 88.5 KB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- Posudek-Oponent prace-20792_o.pdf
Loading...
- Name:
- review_121879.html
- Size:
- 1.44 KB
- Format:
- Hypertext Markup Language
- Description:
- file review_121879.html