Detekce genů v DNA sekvencích
| but.committee | prof. Ing. Jan M. Honzík, CSc. (předseda) doc. Ing. Jiří Kunovský, CSc. (místopředseda) Ing. Martin Hrubý, Ph.D. (člen) doc. Ing. Jan Kořenek, Ph.D. (člen) Mgr. Ing. Pavel Očenášek, Ph.D. (člen) | cs |
| but.defence | Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se pak seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm velmi dobře (B). Otázky u obhajoby: Uveďte a vysvětlete vzorec pro vyplnění pomocné matice algoritmem Smith-Waterman (vzorec 3.3). Zejména vysvětlete, jak z tohoto vzorce vyplývá, že matice nemůže obsahovat záporné hodnoty. V kapitole 2.3 uvádíte, že jednotlivé kodóny kódují 21 různých aminokyselin. V tabulce 2.1 je pouze 20 aminokyselin. Můžete uvést chybějící aminokyselinu a kodón(y), které ji kódují? Je Vámi vytvořená metoda použitelná i pro jiné prokaryotické genomy, nebo pouze pro genom E. coli? | cs |
| but.jazyk | čeština (Czech) | |
| but.program | Informační technologie | cs |
| but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
| dc.contributor.advisor | Martínek, Tomáš | cs |
| dc.contributor.author | Višňovský, Marek | cs |
| dc.contributor.referee | Burgetová, Ivana | cs |
| dc.date.created | 2011 | cs |
| dc.description.abstract | Práce se zaobírá návrhem metody na predikci prokaryotických genů, která pak bude odzkoušená a prezentována na genome Escherichie coli. Jednotlivé kapitoly postupně pojednávají o problematice spojené s tímto návrhem, stručným úvodem do molekulární biologie začínajíc, představením použí-vaných metod detekce respektive predikce genů pokračujíc, až samotným návrhem metody založené především na pozičně specifických maticích končíc. | cs |
| dc.description.abstract | The main goal of this work is to create a method for gene prediction in prokaryotic genomes, which will be later demonstrated and tested on Escherichia coli. The first chapter contains a short introduc-tion into molecular biology. In the second one, we take a closer look on current methods of gene de-tection and prediction and the work ends with an application of acquired knowledge on gene predic-tion mostly using position weight matrices. | en |
| dc.description.mark | B | cs |
| dc.identifier.citation | VIŠŇOVSKÝ, M. Detekce genů v DNA sekvencích [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2011. | cs |
| dc.identifier.other | 42792 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/55835 | |
| dc.language.iso | cs | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | Skryté Markovovy modely | cs |
| dc.subject | pozičně specifická matice | cs |
| dc.subject | predikce prokaryotických genů | cs |
| dc.subject | Hidden Markov Models | en |
| dc.subject | Position Weight Matrix | en |
| dc.subject | prokaryotic gene prediction | en |
| dc.title | Detekce genů v DNA sekvencích | cs |
| dc.title.alternative | Gene Detection in DNA Sequences | en |
| dc.type | Text | cs |
| dc.type.driver | bachelorThesis | en |
| dc.type.evskp | bakalářská práce | cs |
| dcterms.dateAccepted | 2011-06-15 | cs |
| dcterms.modified | 2020-05-09-23:42:57 | cs |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta informačních technologií | cs |
| sync.item.dbid | 42792 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2025.03.18 18:45:26 | en |
| sync.item.modts | 2025.01.15 20:50:38 | en |
| thesis.discipline | Informační technologie | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav počítačových systémů | cs |
| thesis.level | Bakalářský | cs |
| thesis.name | Bc. | cs |