Efektivní analýza stochastických biochemických systémů
but.committee | prof. Ing. Tomáš Vojnar, Ph.D. (předseda) prof. Ing. Jan M. Honzík, CSc. (místopředseda) doc. Ing. Martin Čadík, Ph.D. (člen) doc. Ing. Jan Kořenek, Ph.D. (člen) Ing. Aleš Smrčka, Ph.D. (člen) | cs |
but.defence | Studentka nejprve prezentovala výsledky, kterých dosáhla v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Studentka následně odpověděla na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studentky na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm " C ". Otázky u obhajoby: Proč jste v experimentech nepracovala více s modely biochemických systému, když jsou zmíněny v názvu práce? Bude Vaše práce zařazena do nástroje STORM jeho autory? | cs |
but.jazyk | čeština (Czech) | |
but.program | Informační technologie | cs |
but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
dc.contributor.advisor | Češka, Milan | cs |
dc.contributor.author | Tušimová, Lucia | cs |
dc.contributor.referee | Hruška, Martin | cs |
dc.date.created | 2018 | cs |
dc.description.abstract | Cieľom tejto práce je zefektívniť výpočet biochemických reakčných sietí. Na modelovanie biochemických systémov pomocou numerických metód sa používajú Markovove reťazce v spojitom čase. Problémom pri biochemických reakciách je vznik nezvládnuteľného množstva stavov. Metóda rýchlej adaptívnej uniformizácie rieši tento problém za cenu malej zaokrúhľovacej chyby. Táto metóda bola implementovaná v nástroji STORM, ktorý slúži na analýzu systémov obsahujúcich pravdepodobnostné javy. Následne bola efektivita tejto metódy overená na sade experimentov. | cs |
dc.description.abstract | The aim of the thesis is to make computation of the biochemical reaction networks more efficient. Modeling of biochemical systems using numerical methods uses continuous-time Markov chains. The problem is that in biochemical reactions arises an unmanageable amount of states. The fast adaptive uniformization method solves this problem at the cost of a small rounding mistake. This method was implemented in the STORM, which is tool for the analysis of systems involving random or probabilistic phenomena. Consequently, the effectiveness of this method was verified on a set of experiments. | en |
dc.description.mark | C | cs |
dc.identifier.citation | TUŠIMOVÁ, L. Efektivní analýza stochastických biochemických systémů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2018. | cs |
dc.identifier.other | 114873 | cs |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/85029 | |
dc.language.iso | cs | cs |
dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií | cs |
dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
dc.subject | Biochemické modely | cs |
dc.subject | Markovove reťazce v spojitom čase | cs |
dc.subject | Rýchla adaptívna uniformizácia | cs |
dc.subject | STORM | cs |
dc.subject | Biochemical models | en |
dc.subject | Continuous-time Markov chain | en |
dc.subject | Fast adaptive uniformization | en |
dc.subject | STORM | en |
dc.title | Efektivní analýza stochastických biochemických systémů | cs |
dc.title.alternative | Efficient Analysis of Stochastic Biochemical Systems | en |
dc.type | Text | cs |
dc.type.driver | bachelorThesis | en |
dc.type.evskp | bakalářská práce | cs |
dcterms.dateAccepted | 2018-06-11 | cs |
dcterms.modified | 2020-05-10-16:13:27 | cs |
eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta informačních technologií | cs |
sync.item.dbid | 114873 | en |
sync.item.dbtype | ZP | en |
sync.item.insts | 2025.03.18 19:04:51 | en |
sync.item.modts | 2025.01.17 09:39:14 | en |
thesis.discipline | Informační technologie | cs |
thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav inteligentních systémů | cs |
thesis.level | Bakalářský | cs |
thesis.name | Bc. | cs |
Files
Original bundle
1 - 4 of 4
Loading...
- Name:
- final-thesis.pdf
- Size:
- 1.23 MB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- final-thesis.pdf
Loading...
- Name:
- Posudek-Vedouci prace-21187_v.pdf
- Size:
- 86.54 KB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- Posudek-Vedouci prace-21187_v.pdf
Loading...
- Name:
- Posudek-Oponent prace-21187_o.pdf
- Size:
- 88.57 KB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- Posudek-Oponent prace-21187_o.pdf
Loading...
- Name:
- review_114873.html
- Size:
- 1.46 KB
- Format:
- Hypertext Markup Language
- Description:
- file review_114873.html