Využití různých metod izolace DNA baktérií mléčného kvašení v molekulárně biologických metodách
| but.committee | prof. Ing. Miloslav Pekař, CSc. (předseda) prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (místopředseda) doc. Ing. Pavel Diviš, Ph.D. (člen) doc. Ing. Petr Dzik, Ph.D. (člen) prof. Ing. Stanislav Obruča, Ph.D. (člen) prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (člen) | cs |
| but.defence | Student prezentoval řešenou práci, její teoretická východiska a vlastní výsledky, zodpověděl dotazy položené oponentem a následně byly poleženy dotazy členů komise.Student prezentoval řešenou práci, její teoretická východiska a vlastní výsledky, zodpověděl dotazy položené oponentem a následně byly poleženy dotazy členů komise. Diviš: Jaký typ magnetických nanočástic byl použit pro extrakci? Jak si vysvětlujete nižší výtěžnost extrakce? Jak funguje „DNA kit“?Pekař: Jak si vysvětlujete rozdíly v nalezených a deklarovaných obsazích bakteriální DNA?Márová: Proč jste nepoužila kvantitativní PCR? Jaká by asi byla korelace s gelovou elektroforézou? Student prokázal výbornou orientaci v dané problematice a schopnost samostatné prezentace získaných výsledků. | cs |
| but.jazyk | čeština (Czech) | |
| but.program | Chemie pro medicínské aplikace | cs |
| but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
| dc.contributor.advisor | Brázda, Václav | cs |
| dc.contributor.author | Chvalkovská, Eva | cs |
| dc.contributor.referee | Skoumalová, Petra | cs |
| dc.date.created | 2019 | cs |
| dc.description.abstract | Předkládaná práce se zabývá probiotickými bakteriemi, izolací DNA z těchto baterií třemi různými metodami a vlivu izolace na identifikaci DNA pomocí molekulárně biologických metod. Probiotické bakterie jsou důležitou součástí trávícího traktu člověka. Mají důležitou roli pro funkci imunitního systému, a to díky adhezi na sliznici trávícího traktu, kde vytváří nehostinné prostředí pro patogeny. Probiotické baterie přijímáme běžně v potravě, ať už v mléčných výrobních nebo pomocí doplňků stravy. Díky nadužívání antibiotik ovšem hrozí riziko předání vnitřní rezistence, kterou probiotické bakterie mají kvůli udržení přirozené homeostáze trávícího traktu, patogenním bakteriím. Je tedy důležité efektivně identifikovat rizikové probiotické bakterie, které mají schopnost rezistenci přenášet a eliminovat tak jejich přítomnost v potravinách a potravinových doplňcích. V experimentální části byly zkoumány tři metody izolace DNA, metoda fenolové extrakce, izolace magnetickými částicemi a izolace komerčním kitem. DNA byla izolovaná ze tří doplňků stravy a to Biopron 9 premium, Linex forte a GS Laktobacily forte 21. Čistota a koncentrace izolované DNA byla zjištěna spektrofotometricky. Přítomnost jednotlivých kmenů DNA v potravinových doplňcích byla potvrzena metodou polymerázové řetězové reakce v reálném čase. Jako nejlepší metoda izolace, co se týče čistoty a koncentrace izolované DNA byla na základě RT–PCR a spektrofotometrie vyhodnocena metoda izolace komerčním kitem. | cs |
| dc.description.abstract | This thesis focused on the probiotic bacteria, DNA isolated from these bacteria by three different methods and the effect of isolation on DNA identification using molecular biological methods. Probiotic bacteria are an important part of human intestinal tract. They have an important role in the function of the immune system due to adhesion to the mucosa of the intestinal flora. They create a inhostile environment for pathogens. Probiotic bacteria are commonly taken in the food like dairy products or food supplements. However, overuse of antibiotics is at risk of passing on the intrinsic resistance that probiotic bacteria have to the pathogenic bacteria. The intrinsic resistence they have to maintain the natural homeostasis of the intestinal tract. It is important to effectively identify risky probiotic bacteria that have the ability to transmit resistance to eliminate their presence in food and dietary supplements. Three methods of DNA isolation like phenol extraction method, magnetic particle isolation and commercial kit isolation were used in the experimental part. DNA was isolated from three dietary supplements, namely Biopron 9 premium, Linex forte and GS Lactobacily forte 21. The purity and concentration of the isolated DNA was detected spectrophotometrically. The presence of individual DNA strains in dietary supplements was confirmed by real-time polymerase chain reaction. The best method of isolation in terms of purity and concentration of isolated DNA was evaluated by RT-PCR and spectrophotometry using a commercial kit isolation method. | en |
| dc.description.mark | A | cs |
| dc.identifier.citation | CHVALKOVSKÁ, E. Využití různých metod izolace DNA baktérií mléčného kvašení v molekulárně biologických metodách [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2019. | cs |
| dc.identifier.other | 115253 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/177451 | |
| dc.language.iso | cs | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | Probiotické bakterie | cs |
| dc.subject | magnetické částice | cs |
| dc.subject | fenolová extrakce | cs |
| dc.subject | komerční kit | cs |
| dc.subject | PCR v reálném čase | cs |
| dc.subject | Probiotic bactera | en |
| dc.subject | magnetic particles | en |
| dc.subject | phenol extraction | en |
| dc.subject | commercial kit | en |
| dc.subject | real–time PCR | en |
| dc.title | Využití různých metod izolace DNA baktérií mléčného kvašení v molekulárně biologických metodách | cs |
| dc.title.alternative | Using different methods of DNA isolation of lactic acid bacteria in molecular biological methods | en |
| dc.type | Text | cs |
| dc.type.driver | masterThesis | en |
| dc.type.evskp | diplomová práce | cs |
| dcterms.dateAccepted | 2019-05-28 | cs |
| dcterms.modified | 2019-05-29-08:25:34 | cs |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta chemická | cs |
| sync.item.dbid | 115253 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2025.03.26 09:53:31 | en |
| sync.item.modts | 2025.01.17 14:53:51 | en |
| thesis.discipline | Chemie pro medicínské aplikace | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. Ústav fyzikální a spotřební chemie | cs |
| thesis.level | Inženýrský | cs |
| thesis.name | Ing. | cs |