but.committee	prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (předseda) doc. Ing. Stanislav Obruča, Ph.D., oponent (člen) doc. Ing. Pavel Diviš, Ph.D. (člen) doc. Ing. Adriána Kovalčík, Ph.D. (člen) doc. Ing. Eva Vítová, Ph.D. (člen) prof. RNDr. Jiří Doškař, CSc. (člen) prof. RNDr. František Krčma, Ph.D. (člen) doc. RNDr. Miloslava Fojtová, Ph.D., oponent (člen)	cs
but.defence	Předsedkyně komise představila doktorandku a předala jí slovo. Ing. Čutová má již řadu pracovních zkušeností (2006–2007: IVAX Pharmaceuticals s.r.o. (TEVA) Opava, laborant, 2009–2010: BioVendor, Brno, laborant, 2014–2016: McBride Czech a.s., Brno, laborant fyzikální chemie.) Co se publikační činnosti týče, u 2 publikací ze 3 je prvním autorem. Je spoluautorkou 7 konferenčních příspěvků. Ve své powerpointové prezentaci doktorandka představila výsledky své dizertační práce. Oponenti přečetly své posudky. Oba byly kladné a doporučovaly práci k obhajobě. Oponenti položili řadu dotazů, na všechny dotazy doktorandka uspokojivým způsobem odpověděla. Otázky vzešlé z diskuze jsou bodově uvedeny na přiložených lístcích, které se archivují.	cs
but.jazyk	čeština (Czech)
but.program	Chemie a technologie potravin	cs
but.result	práce byla úspěšně obhájena	cs
dc.contributor.advisor	Brázda, Václav	cs
dc.contributor.author	Čutová, Michaela	cs
dc.contributor.referee	Obruča, Stanislav	cs
dc.contributor.referee	Fojtová,, Miloslava	cs
dc.date.accessioned	2019-12-05T15:55:52Z
dc.date.available	2019-12-05T15:55:52Z
dc.date.created	2019	cs
dc.description.abstract	Identifikace bakteriální DNA se skládá z několika kroků: lyze buněk, izolace a purifikace DNA, precipitace ethanolem a identifikace bakteriálního kmene pomocí PCR, případně i jiných molekulárně biologických metod. Každý krok musí být optimalizován. Nukleové kyseliny lze z buněk s výhodou izolovat pomocí magnetických nosičů. Molekuly DNA jsou na povrch magnetického nosiče navázány na základě elektrostatických interakcí a posléze jsou eluovány do pufru. Cílem práce bude optimalizace jednotlivých kroků identifikace bakteriální DNA: buněčná lyze, izolace DNA, charakterizace pevných magnetických nosičů funkcionalizovaných aminoskupinami pro izolaci nukleových kyselin. Přítomnost DNA v eluátu bude ověřena pomocí gelové agarosové elektroforézy a množství eluované DNA bude stanoveno spektrofotometricky. Kvalita izolované DNA bude bude ověřena její amplifikací s použitím polymerázové řetězové reakce (PCR). Dále je práce zaměřena na studium sekundárních struktur nukleových kyselin – křížových struktur a kvadruplexů. Tyto struktury se podílí na regulaci buněčných procesů a jejich výskyt je spojován s vývojem onkologických a neurodegenerativních onemocnění. Byla provedena analýza genomu in silico u mikroorganizmů významných v potravinářském průmyslu. Sevence genomů mikroorganismů byly získány z databáze NCBI (National Center for Biotechnology). Pro analýzu byl použit software Palindrome Analyser a G4 Hunter.	cs
dc.description.abstract	Identification of bacterial DNA consists from several steps: cell lysis, isolation and purification of DNA, precipitation by ethanol, identification of bacterial strain by PCR or other molecular biology methods. Each step must be optimised. Nucleic acids can be isolated from cells using magnetic particles. The molecules of DNA are bound to the surface of magnetic carriers by electrostatic interaction, and then they are eluted into buffer. The aim of the work will be to optimize individual steps of identification of bacterial DNA: cell lysis, DNA isolation, characterization of solid magnetic carriers functionalized by amino groups for nucleic acids isolation. The presence of DNA will be verified using agarose gel electrophoresis and the amount of eluted DNA will be determined spectrophotometrically. The quality of isolated DNA will be proved by their amplification using polymerase chain reaction (PCR). Furthermore, the thesis focuses on the study of secondary structures of nucleic acids – cruciforms structures and quadruplexes. These structures are involved in the regulation of cellular processes and their appearance is associated with cancer development and neurodegenerative diseases. In silico genome analysis was performed on important food industry microorganisms. The microorganisms genomic sequences were obtained from the NCBI (National Center for Biotechnology) database. The Palindrome Analyzer and G4 Hunter software were used for the analysis.	en
dc.description.mark	P	cs
dc.identifier.citation	ČUTOVÁ, M. Izolace a analýza DNA se zaměřením na mikroorganismy důležité v potravinářství [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2019.	cs
dc.identifier.other	121411	cs
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11012/184087
dc.language.iso	cs	cs
dc.publisher	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická	cs
dc.rights	Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení	cs
dc.subject	Magnetické částice DNA PCR Invertované repetice Kvadruplexy	cs
dc.subject	Magnetic particles DNA PCR Inverted repeats Quadruplexes	en
dc.title	Izolace a analýza DNA se zaměřením na mikroorganismy důležité v potravinářství	cs
dc.title.alternative	DNA Isolation and Analysis Focused on Microorganisms Important in Food Production	en
dc.type	Text	cs
dc.type.driver	doctoralThesis	en
dc.type.evskp	dizertační práce	cs
dcterms.dateAccepted	2019-12-05	cs
dcterms.modified	2019-12-05-17:32:59	cs
eprints.affiliatedInstitution.faculty	Fakulta chemická	cs
sync.item.dbid	121411	en
sync.item.dbtype	ZP	en
sync.item.insts	2021.11.10 14:24:49	en
sync.item.modts	2021.11.10 13:03:37	en
thesis.discipline	Potravinářská chemie	cs
thesis.grantor	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. Ústav chemie potravin a biotechnologií	cs
thesis.level	Doktorský	cs
thesis.name	Ph.D.	cs

Izolace a analýza DNA se zaměřením na mikroorganismy důležité v potravinářství

Files

Original bundle

Collections