Využití numerických reprezentací ve zpracování nukleotidových sekvencí

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Aleš Drastich, CSc. (místopředseda) Ing. Milan Blaha, Ph.D. (člen) MUDr. Zuzana Nováková, Ph.D. (člen) MUDr. Šárka Sekorová (člen) Ing. Denisa Maděránková, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Maděránková: V čem spočívá výhodnost zmíněného nastavení parametrů? Proč je referenční strom z části sekvencí odlišný od stromu z celé délky sekvencí? Je referenční dendrogram skutečně ten správný? Student obhájil bakalářskou práci s výhradami a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorKubicová, Vladimíracs
dc.contributor.authorKošíček, Adamcs
dc.contributor.refereeMaděránková, Denisacs
dc.date.created2014cs
dc.description.abstractPřevod sekvencí DNA na vhodnou reprezentaci je důležitou úkolem před samotným započetím analýzy a dalšího zpracování. Hlavním úkolem této práce bylo se seznámit s typy numerických a grafických reprezentací a jejich využitím pro analýzu DNA. Vzhledem k velkému množství metod a postupů, byly do této práce vybrány pouze některé. Některé metody nelze přímo klasifikovat jako numerické nebo grafické, protože obsahují možnost obojí reprezentace. Tyto metody byly zařazeny mezi grafické reprezentace. Pro vybrané metody byly vytvořeny fylogenetické stromy pro porovnání přesnosti. Závěrem práce je zhodnocení získaných výsledků.cs
dc.description.abstractConversion of DNA sequences for appropriate representation is important task before initiation of analyzes and further processing. The main goal of this work was to get familiar with types of numerical and graphical representations and their application for DNA analyzes. In consideration of great volume of methods and procedures, only a few were chosen for this work. Some methods can not be classified only as numerical or graphical representations, because of option allowing them to be converted into both of these representations. These methods were classified as graphical representations. Phylogenetic trees were programmed for chosen methods to compare its precision. Outcome of this work is summing up the results.en
dc.description.markCcs
dc.identifier.citationKOŠÍČEK, A. Využití numerických reprezentací ve zpracování nukleotidových sekvencí [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2014.cs
dc.identifier.other72829cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/33397
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectDNA sekvencecs
dc.subjectnumerická reprezentacecs
dc.subjectgrafická reprezentacecs
dc.subjectCpG ostrůvkycs
dc.subjectkódující sekvencecs
dc.subjectpodobnostcs
dc.subjectdendrogramcs
dc.subjectkritériumcs
dc.subjectDNA sequenceen
dc.subjectnumerical representationen
dc.subjectgraphical representationen
dc.subjectCpG islandsen
dc.subjectcoding sequenceen
dc.subjectsimilarityen
dc.subjectphylogenetic treeen
dc.subjectcriterionen
dc.titleVyužití numerických reprezentací ve zpracování nukleotidových sekvencícs
dc.title.alternativeThe use of numerical representations in processing of nucleotide sequencesen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2014-06-18cs
dcterms.modified2014-06-20-10:10:43cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid72829en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.16 13:29:57en
sync.item.modts2025.01.17 12:52:11en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
1.46 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
file final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
57.78 KB
Format:
Unknown data format
Description:
file appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_72829.html
Size:
5.03 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_72829.html
Download
Collections
2014