Příznaky pro analýzu a klasifikaci buněk ve snímcích z holografického mikroskopu

Abstract

Tato bakalářská práce se zabývá problematikou příznaků používaných při analýze snímků buněk pořízených holografickým mikroskopem a pro jejich klasifikaci. Popisuje jednotlivé příznaky, stejně tak jako nástroje pro klasifikaci. Příznaky jsou extrahovány na dodaných nasegmentovaných buňkách v programovém prostředí Matlab. Na základě těchto příznaků jsou buňky klasifikovány s využitím metody podpůrných vektorů. Pomocí metod pro shlukování a redukci dimenzionality je analyzován výskyt různých buněčných typů. Zároveň je zhodnocena účinnost a využitelnost jednotlivých příznaků.This thesis deals with features used for analysis and classification of cell images captured by holographic microscope. Distinctive features are described together with tools for their classification. Features are extracted on provided segmented cells with use of Matlab programming environment. Based on extracted features the cells are classified by SVM classificator. With use of clustering methods and dimensionality reduction different cell types are analyzed. Reliabity of each feature is tested.