but.committee	prof. RNDr. Jiří Petráček, Dr. (předseda) prof. RNDr. Pavel Zemánek, Ph.D. (člen) prof. RNDr. Radim Chmelík, Ph.D. (člen) prof. Mgr. Tomáš Tyc, Ph.D. (člen) prof. Monika Ritsch-Marte (člen)	cs
but.defence	Hlavním výsledkem práce je úspěšná demonstrace zobrazovaná pomocí mnohamódového vlákna CARS signálu. Realizovaní metody jsou unikátní pečlivým provedením a svou komplexností.	cs
but.jazyk	angličtina (English)
but.program	Fyzikální a materiálové inženýrství	cs
but.result	práce byla úspěšně obhájena	cs
dc.contributor.advisor	Čižmár, Tomáš	en
dc.contributor.author	Pikálek, Tomáš	en
dc.contributor.referee	Marte, Monika Ritsch-	en
dc.contributor.referee	Zemánek, Pavel	en
dc.date.created	2024	cs
dc.description.abstract	Multimodová vlákna je možné využít jako miniaturní endoskopy pro zobrazování hluboko uvnitř mozku myších zvířecích modelů s minimálním poškozením okolní tkáně. S využitím metod tvarování vlnoplochy je možné svazek vystupující z vlákna fokusovat do jediného bodu, a vytvořit tak miniaturní skenovací mikroskop. Různé mikroskopické zobrazovací metody již byly tímto způsobem implementovány, a to včetně několika in-vivo demonstrací. Tato práce se zabývá implementací zobrazování pomocí koherentního anti-Stokesova Ramanova rozptylu (CARS), nelineární metody umožňující zobrazování s chemickým kontrastem bez značení vzorku. Tato metoda má potenciální využití pro klinické aplikace například při diagnóze nádorů. Práce je zaměřena zejména na optimalizaci endoskopu a vláknových sond pro fokusaci světla z pulzních laserů včetně kontroly disperze s cílem umožnit nelineární zobrazování. Takto optimalizovaný systém je následně využit pro demonstraci zobrazování metodou CARS uvnitř tkáně (například lipidové dvojvrstvy buněčných membrán kolem axonů) a chemického kontrastu na polymerových kuličkách. Systém je též použit k demonstraci multimodálního zobrazování fixované myší tkáně kombinací CARS a dvoufotonové mikroskopie.	en
dc.description.abstract	Multimode fibres have recently shown promise as miniature endoscopic probes for imaging deep inside brain tissue of mouse animal models with minimal damage. By employing wavefront shaping, the speckle pattern associated with coherent light propagation through a multimode fibre can be transformed into a tightly focused point, essentially turning the fibre into a miniature point-scanning device. Many microscopic techniques have been successfully implemented through a multimode fibre, and even in-vivo imaging has been demonstrated. This work extends the capabilities to label-free non-linear microscopy with chemical contrast using coherent anti-Stokes Raman scattering (CARS), which can potentially extend the use of multimode fibre endoscopes to clinical applications for, for example, tumour diagnosis. The main focus is the optimisations of the endoscopic system and the fibre probe to allow efficient focusing of pulsed light through multimode fibres, including dispersion control and thus allowing implementation of non-linear imaging techniques. The optimised setup is then employed to demonstrate CARS imaging of biologically relevant tissue, such as myelinated axons in a mouse brain, and chemical selectivity is verified by imaging polymer beads. In addition, multimodal CARS and two-photon excitation fluorescence (TPEF) imaging of fixed mouse tissue is demonstrated.	cs
dc.description.mark	P	cs
dc.identifier.citation	PIKÁLEK, T. Multiphoton and non-linear Raman microscopy through a multimode fibre [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství. 2024.	cs
dc.identifier.other	154757	cs
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11012/245243
dc.language.iso	en	cs
dc.publisher	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství	cs
dc.rights	Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení	cs
dc.subject	zobrazování multimodovým vláknem	en
dc.subject	endoskopie	en
dc.subject	nelineární mikroskopie	en
dc.subject	dvoufotonová mikroskopie	en
dc.subject	koherentní anti-Stokesův Ramanův rozptyl	en
dc.subject	multimode fibre imaging	cs
dc.subject	endoscopy	cs
dc.subject	non-linear microscopy	cs
dc.subject	two-photon excitation fluorescence (TPEF)	cs
dc.subject	coherent anti-Stokes Raman spectroscopy (CARS)	cs
dc.title	Multiphoton and non-linear Raman microscopy through a multimode fibre	en
dc.title.alternative	Multiphoton and non-linear Raman microscopy through a multimode fibre	cs
dc.type	Text	cs
dc.type.driver	doctoralThesis	en
dc.type.evskp	dizertační práce	cs
dcterms.dateAccepted	2024-02-20	cs
dcterms.modified	2024-02-28-07:47:33	cs
eprints.affiliatedInstitution.faculty	Fakulta strojního inženýrství	cs
sync.item.dbid	154757	en
sync.item.dbtype	ZP	en
sync.item.insts	2025.03.27 15:37:22	en
sync.item.modts	2025.02.26 05:32:29	en
thesis.discipline	Fyzikální a materiálové inženýrství	cs
thesis.grantor	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství. Ústav fyzikálního inženýrství	cs
thesis.level	Doktorský	cs
thesis.name	Ph.D.	cs

Multiphoton and non-linear Raman microscopy through a multimode fibre

Files

Original bundle

Collections