Metody vyhledávání tandemových repetic v DNA sekvencích

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda) MUDr. Marie Nováková, Ph.D. (místopředseda) Ing. Denisa Maděránková, Ph.D. (člen) Ing. Oto Janoušek, Ph.D. (člen) Mgr. Daniel Vlk, CSc. (člen) MUDr. Kateřina Fialová, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Student obhájil bakalářskou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorMaděránková, Denisacs
dc.contributor.authorHavlík, Kryštofcs
dc.contributor.refereeSedlář, Karelcs
dc.date.accessioned2019-04-03T22:52:59Z
dc.date.available2019-04-03T22:52:59Z
dc.date.created2015cs
dc.description.abstractV této práci je objasněna základní problematika repetitivní DNA a jsou zde zhodnoceny vyhledávače tandemových repetic bezplatně dostupné široké veřejnosti. V praktické části práce je popsán algoritmus sloužící k vyhledávání tandemových repetic založený na převodu sekvence DNA do číselného formátu. Následuje zpracování vzniklého signálu pomocí krátkodobé Fourierovy transformace, vytvoření spektrogramu, jehož analýza slouží k nalezení pozice a obsahu repetitivních oblastí. Výsledkem práce je porovnání výstupů vybraných volně dostupných programů s vytvořeným programem a zhodnocení výhod a nevýhod.cs
dc.description.abstractThis work clarifies basics of the repetitive DNA and evaluates thee tandem repeats finders, which are accessible to public free of payment. Second part describes an algorithm used for searching tandem repeats, based on converting DNA string into numerical signal. Then follows signal processing using short-time Fourier transform, formation of spectrogram and analysis for evaluating position and content of repetitive areas. Result of this work is comparison of outcomes provided by public accessible programs with results of created program and review of advantages and disadvantages.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationHAVLÍK, K. Metody vyhledávání tandemových repetic v DNA sekvencích [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2015.cs
dc.identifier.other84346cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/40697
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectRepetitivní DNAcs
dc.subjecttandemové repeticecs
dc.subjectFourierova transformacecs
dc.subjectnumericky reprezentovaná DNA.cs
dc.subjectRepetitive DNAen
dc.subjecttandem repeatsen
dc.subjectFourier transformen
dc.subjectnumerically represented DNA.en
dc.titleMetody vyhledávání tandemových repetic v DNA sekvencíchcs
dc.title.alternativeMethods of DNA tandem repeats analysisen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2015-06-17cs
dcterms.modified2015-06-18-15:25:33cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid84346en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.12 17:58:33en
sync.item.modts2021.11.12 17:28:14en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
2.79 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
342.23 KB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_84346.html
Size:
4.71 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_84346.html
Download
Collections
2015