Optimalizace distribuovaného I/O subsystému projektu k-Wave

but.committeedoc. Ing. František Zbořil, CSc. (předseda) prof. RNDr. Milan Češka, CSc. (místopředseda) Ing. Martin Hrubý, Ph.D. (člen) doc. Ing. Jan Janoušek, Ph.D. (člen) Dr. Ing. Petr Peringer (člen) RNDr. Marek Rychlý, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm B. Otázky u obhajoby: Zkoušel jste testovat a optimalizovat ukládání dat s rozměry většími než 512^3? Jaké očekáváte chování po optimalizaci? Jak by se dal systém ukládání dat optimalizovat v případě, že by měla být data vždy uložena po 3D blocích (chunky) 64^3, které jsou daleko více optimálnější pro pozdější zpracování dat a jejich vizualizaci?cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programInformační technologiecs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorJaroš, Jiřícs
dc.contributor.authorVysocký, Ondřejcs
dc.contributor.refereeKlepárník, Petrcs
dc.date.accessioned2019-04-03T22:26:54Z
dc.date.available2019-04-03T22:26:54Z
dc.date.created2016cs
dc.description.abstractPráce se zabývá řešením efektivního paralelního zápisu a čtení dat pro nástroj k-Wave, provádějící simulací šíření ultrazvuku. Tento nástroj je superpočítačovou aplikací, proto je spouštěn na souborovém systému Lustre a vyžaduje paralelní zpracování pomocí MPI a zápis ve formátu vhodném pro velké množství dat (HDF5). V rámci této práce byly navrženy metody efektivního způsobu zápisu dat dle potřeb k-Wave, pomocí kumulace dat a přerozdělování. Všechny metody zrychlily nativní zápis a vedly až k rychlosti zápisu 13,6GB/s. Popsané metody jsou použitelné pro všechny aplikace s distribuovanými daty a častým zápisem.cs
dc.description.abstractThis thesis deals with an effective solution of the parallel I/O of the k-Wave tool, which is designed for time domain acoustic and ultrasound simulations. k-Wave is a supercomputer application, it runs on a Lustre file system and it requires to be implemented with MPI and stores the data in suitable data format (HDF5). I designed three methods of optimization which fits k-Wave's needs. It uses accumulation and redistribution techniques. In comparison with the native write, every optimization method led to better write speed, up to 13.6GB/s. It is possible to use these methods to optimize every data distributed application with the write speed issue.en
dc.description.markBcs
dc.identifier.citationVYSOCKÝ, O. Optimalizace distribuovaného I/O subsystému projektu k-Wave [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2016.cs
dc.identifier.other96514cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/61900
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectk-Wavecs
dc.subjectparalelní programovánícs
dc.subjectMPIcs
dc.subjectHDF5cs
dc.subjectLustrecs
dc.subjectsuperpočítačcs
dc.subjectI/Ocs
dc.subjectzápiscs
dc.subjectoptimalizacecs
dc.subjectk-Waveen
dc.subjectParallel Programmingen
dc.subjectMPIen
dc.subjectHDF5en
dc.subjectHierarchical Data Formaten
dc.subjectLustreen
dc.subjectSupercomputeren
dc.subjectI/Oen
dc.subjectWriteen
dc.subjectOptimizationen
dc.titleOptimalizace distribuovaného I/O subsystému projektu k-Wavecs
dc.title.alternativeOptimization of the Distributed I/O Subsystem of the k-Wave Projecten
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2016-06-23cs
dcterms.modified2020-05-10-16:12:39cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta informačních technologiícs
sync.item.dbid96514en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.12 18:12:01en
sync.item.modts2021.11.12 17:12:10en
thesis.disciplineInteligentní systémycs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav počítačových systémůcs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 4 of 4
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
3.58 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Vedouci prace-18742_v.pdf
Size:
86.52 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek-Vedouci prace-18742_v.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Oponent prace-18742_o.pdf
Size:
89.53 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek-Oponent prace-18742_o.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
review_96514.html
Size:
1.46 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_96514.html
Collections