Implementace nástroje pro analýzu lokálních struktur DNA
Loading...
Date
Authors
Kaura, Patrik
Advisor
Referee
Mark
A
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství
ORCID
Abstract
Tato diplomová práce je zaměřena na popis a realizaci aplikace API wrapper, která pracuje nad výpočetním jádrem ibp bioinformatics. První polovina práce se zaměřuje na shrnutí základních znalostí z oblasti výzkumu DNA, rovněž i specifikaci problému a popisu zvolených technologií. Druhá polovina se soustředí na samotnou realizaci, distribuci a vyhodnocení použitelnosti aplikace na konkrétních sekvencích DNA.
This diploma thesis is focused on the description and implementation of the API wrapper application, which works on top of computational core ibp bioinformatics. The first half of the thesis is focused on the summary of basic knowledge in the field of DNA research, as well as the specification of the problem and description of selected technologies. The other half deals with the actual implementation, distribution, and evaluation of application applicability on specific DNA sequences.
This diploma thesis is focused on the description and implementation of the API wrapper application, which works on top of computational core ibp bioinformatics. The first half of the thesis is focused on the summary of basic knowledge in the field of DNA research, as well as the specification of the problem and description of selected technologies. The other half deals with the actual implementation, distribution, and evaluation of application applicability on specific DNA sequences.
Description
Keywords
REST API , Python , Jupyter notebook , pypi , DNA , lokální struktury , guaninový kvadruplex , REST API , Python , Jupyter notebook , pypi , DNA , local structures , guanine quadruplex
Citation
KAURA, P. Implementace nástroje pro analýzu lokálních struktur DNA [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství. 2019.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Aplikovaná informatika a řízení
Comittee
prof. Ing. Dagmar Janáčová, CSc. (předseda)
doc. Ing. Jan Chyský, CSc. (místopředseda)
prof. RNDr. Ing. Jiří Šťastný, CSc. (člen)
prof. RNDr. Ing. Miloš Šeda, Ph.D. (člen)
doc. RNDr. Jindřich Klapka, CSc. (člen)
Date of acceptance
2019-06-19
Defence
Student odprezentoval svou práci.
Student odpověděl na otázky oponenta a dodatečné otázky komise.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena