Identifikace PHA produkujících bakterií pomocí nástrojů molekulární biologie
| but.committee | prof. Ing. Miloslav Pekař, CSc. (předseda) prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (místopředseda) doc. Ing. Pavel Diviš, Ph.D. (člen) doc. Ing. Petr Dzik, Ph.D. (člen) doc. Ing. Stanislav Obruča, Ph.D. (člen) prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (člen) | cs |
| but.defence | Pekař: Jakým způsobem probíhalo vzokování ve stáji? Márová: Proč si vybíráte tak absurdní místa pro izolaci kmenů? | cs |
| but.jazyk | čeština (Czech) | |
| but.program | Chemie pro medicínské aplikace | cs |
| but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
| dc.contributor.advisor | Obruča, Stanislav | cs |
| dc.contributor.author | Gajdová, Barbora | cs |
| dc.contributor.referee | Obručová,, Hana | cs |
| dc.date.accessioned | 2018-10-21T16:34:51Z | |
| dc.date.available | 2018-10-21T16:34:51Z | |
| dc.date.created | 2017 | cs |
| dc.description.abstract | Tato diplomová práce se zabývá identifikací bakterií, které jsou schopny produkce polyhydroxyalkanoátů (PHA). Mezi testovanými bakteriemi byli převážně zástupci rodu Pseudomonas, Lactobacillus, Bifidobacterium, dále vzorky z termofilní kultury a vzorky z přírodních zdrojů. Bakterie byly testovány pomocí molekulárně biologické metody PCR. Byla analyzována amplifikace genu kódujícího PHA syntázu (phaC). V první reakci byl detekován jak phaC gen zodpovědný za syntézu PHA, tak současně i 16S rRNA, který slouží jako ověření bakteriální DNA a u neznámých vzorků z přírodních zdrojů sloužil také jako způsob identifikace konkrétního kmenu. Jednalo se o multiplexní PCR, která využívala více primerů ve směsi pro PCR. Druhou reakcí byl hledán amplikon, který je specifický pro syntázu, jež katalyzuje biosyntézu mcl-PHA (phaC1). Přítomnost genu pro tvorbu PHA syntázy byla prokázána u 11 vzorků a těmi byly Bifidobacterium breve CCM 7825T, Lactobacillus rhamnosus CCM 1825T, Lactobacillus zeae CCM 7069T, Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus CCM 7190T, Lactobacillus plantarum CCM 7039T, Pseudomonas gessardii, Pseudomonas fulva, Arthrobacter protophormiae, Curtobacterium flaccumfaciens, Mycobacterium neoaurum a Staphylococcus lentus. | cs |
| dc.description.abstract | This diploma thesis deals with identification of bacteria which are capable of producing polyhydroxyalkanoates (PHAs). Work included testing variety of genera including Pseudomonas, Lactobacillus, Bifidobacterium, thermophilic cultures and samples gathered from natural sources. Bacteria were investigated by molecular technique polymerase chain reaction – PCR. An amplification of the PHA synthase gene (phaC) was analyzed. In the first reaction phaC and 16S rRNA genes were tested at the same time. 16S rRNA gene is used as control for bacterial DNA and as an identification tool for natural source samples. This multiplex PCR used multiple primers in PCR mix. Second reaction search for amplicon specific for catalysing biosynthesis mcl-PHA (phaC1). The presence of the PHA synthase gene was verified in 11 samples which were Bifidobacterium breve CCM 7825T, Lactobacillus rhamnosus CCM 1825T, Lactobacillus zeae CCM 7069T, Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus CCM 7190T, Lactobacillus plantarum CCM 7039T, Pseudomonas gessardii, Pseudomonas fulva, Arthrobacter protophormiae, Curtobacterium flaccumfaciens, Mycobacterium neoaurum and Staphylococcus lentus. | en |
| dc.description.mark | B | cs |
| dc.identifier.citation | GAJDOVÁ, B. Identifikace PHA produkujících bakterií pomocí nástrojů molekulární biologie [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2017. | cs |
| dc.identifier.other | 97816 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/65074 | |
| dc.language.iso | cs | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | PCR | cs |
| dc.subject | bakteriální polyhydroxyalkanoáty | cs |
| dc.subject | elektroforéza | cs |
| dc.subject | PHA syntáza | cs |
| dc.subject | PCR | en |
| dc.subject | bacterial polyhydroxyalcanoates | en |
| dc.subject | electrophoresis | en |
| dc.subject | PHA synthase | en |
| dc.title | Identifikace PHA produkujících bakterií pomocí nástrojů molekulární biologie | cs |
| dc.title.alternative | Identification of PHA producing bacteria employing molecular techniques | en |
| dc.type | Text | cs |
| dc.type.driver | masterThesis | en |
| dc.type.evskp | diplomová práce | cs |
| dcterms.dateAccepted | 2017-06-07 | cs |
| dcterms.modified | 2017-06-08-07:54:10 | cs |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta chemická | cs |
| sync.item.dbid | 97816 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2021.11.12 15:15:23 | en |
| sync.item.modts | 2021.11.12 14:34:49 | en |
| thesis.discipline | Chemie pro medicínské aplikace | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. Ústav fyzikální a spotřební chemie | cs |
| thesis.level | Inženýrský | cs |
| thesis.name | Ing. | cs |