Nástroj pro správu databáze sekvenčních typů patogenních bakterií

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (předseda) Mgr. Daniel Vlk, CSc. (místopředseda) Ing. Lukáš Smital, Ph.D. (člen) Dr. Ing. Vlastimil Vondra (člen) doc. MUDr. Iva Slaninová, Ph.D. (člen) Mgr. Ing. Karel Sedlář, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Dr. Vondra položil otázku: Používá se váš software k vyhodnocení vzorků v laboratoři? Je software certifikován? Ing. Smital položil otázku. Jakým způsobem se bude práce reálně využívat? Studentka obhájila bakalářskou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorSedlář, Karelcs
dc.contributor.authorFrantišová, Zuzanacs
dc.contributor.refereeMaděránková, Denisacs
dc.date.accessioned2021-06-13T22:55:43Z
dc.date.available2021-06-14cs
dc.date.created2018cs
dc.description.abstractPředmětem této bakalářské práce je návrh a vytvoření nástroje pro správu databáze dosud známých sekvenčních typů patogenních bakterií. Základem práce je návrh převodního klíče nové techniky pro typizaci patogenních bakterií vytvořené ve spolupráci s Centrem molekulární biologie a genové terapie Interní hematologické a onkologické kliniky Fakultní nemocnice Brno. Metoda je založena na překladu sekvenčních typů na příslušející melt typ. V prvních dvou kapitolách jsou diskutovány výhody a nevýhody nejpoužívanějších molekulárně-biologických metod a z nich vycházejících metod pro bakteriální typizaci. Další tři kapitoly pak představují návrh převodního klíče pro novou metodu, jeho implementaci do prostředí MATLAB a výsledný nástroj složený ze dvou programů. Výpočet převodního klíče je součástí prvního z programů, druhý program umožňuje zpětně vyhledat konkrétní melt a příslušný sekvenční typ, a tak snadno srovnat sekvenační a PCR data.cs
dc.description.abstractThe objective of this bachelor thesis is to design and create a management tool for sequence types database of pathogenic bacteria. The basis of this thesis is the designing a transfer key for the new molecular technique for typing of bacteria, which was created in cooperation with Centre of Molecular Biology and Gene Therapy, Department of Internal Medicine – Haematooncology, University Hospital Brno. The new method is based on translation sequence type to appropriate melt type. In the first two chapters, the advantages and disadvantages of the most used methods in molecular biology and the most favorite typing methods are discussed. Another three chapters introduce designing of the transfer key, its implementation in the MATLAB environment and the final management tool consisted of two programmes. The first program includes transfer key computation and the second program allows particular melt type and appropriate sequence types retrieval, which is an easy way to compare sequential and PCR data.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationFRANTIŠOVÁ, Z. Nástroj pro správu databáze sekvenčních typů patogenních bakterií [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2018.cs
dc.identifier.other110495cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/197301
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsPřístup k plnému textu prostřednictvím internetu byl licenční smlouvou omezen na dobu 3 roku/letcs
dc.subjectsekvenční typcs
dc.subjectpřevodní klíčcs
dc.subjectmelt typcs
dc.subjecttypizace dle sekvencí mnoha lokusůcs
dc.subjectmini typizacecs
dc.subjectsequence typeen
dc.subjecttransfer keyen
dc.subjectmelt typeen
dc.subjectMulti Locus Sequence Typingen
dc.subjectMinim Typingen
dc.titleNástroj pro správu databáze sekvenčních typů patogenních bakteriícs
dc.title.alternativeManagement tool for sequence types database of pathogenic bacteriaen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2018-06-14cs
dcterms.modified2018-06-18-07:32:02cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid110495en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.12 13:58:23en
sync.item.modts2021.11.12 13:37:07en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
2 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
2.83 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_110495.html
Size:
5.2 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_110495.html
Download
Collections
2018