Obrazová analýza mitotických chromosomů
| but.committee | doc. Ing. Jiří Kozumplík, CSc. (předseda) doc. RNDr. Jaromír Baštinec, CSc. (místopředseda) doc. RNDr. Michal Masařík, Ph.D. (člen) Ing. Jan Odstrčilík, Ph.D. (člen) Ing. Helena Vítková, Ph.D. (člen) Ing. Roman Jakubíček, Ph.D. (člen) | cs |
| but.defence | Student prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Doc. Baštinec: Používáte "úspěšnost detekce". Kde berete tato čísla? Můžete metodu použít při chromozomech do písmene T? Ing. Jakubíček: Používáte aktivní kontury? Jaký používáte algoritmus nebo příkaz v Matlabu? Která metoda umožňuje změnu topologie kontury? Student obhájil magisterskou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta. | cs |
| but.jazyk | čeština (Czech) | |
| but.program | Biomedicínské inženýrství a bioinformatika | cs |
| but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
| dc.contributor.advisor | Vítková, Helena | cs |
| dc.contributor.author | Jaroš, Luboš | cs |
| dc.contributor.referee | Vítek, Martin | cs |
| dc.date.created | 2017 | cs |
| dc.description.abstract | Rozvoj moderní medicíny umožňuje studovat lidský genom a odhalovat predispozice pro odlišné nemoci. Jednou z takových technik je analýza lidského karyotypu, tedy souboru všech chromosomů. Nejdůležitějším krokem při analýze karyotypu je detekce chromosomů a jejich kategorizace. V práci jsem navrhl nový algoritmus pro detekci a kategorizaci chromosomů do sedmi skupin z mikroskopického snímku vzorku DNA. Implementace algoritmu byla provedena v prostředí Matlab. Pro ověření přesnosti segmentace a klasifikace chromosomů byl algoritmus testován na snímcích ze dvou databází (117 a 38 snímků). Sensitivita segmentace činí 88% a pozitivní prediktivní hodnota segmentace je 92%. Úspěšnost párování chromosomů je 77%. | cs |
| dc.description.abstract | The development in modern medicine has allowed to study human genome and detect predispositions to several diseases. One of very promising techniques is the analysis of human karyotype, i.e., the number and appearance of chromosomes in the cell nucleus. The most important step in the karyotype analysis is the chromosome detection and categorization. In this work, a new algorithm for detection of chromosomes from an image of microscopic DNA sample and their categorization into seven groups was developed. The algorithm was implemented in Matlab. The accuracy of segmentation and classification was tested on a set of images from two databases with 117 and 38 images, respectively. The sensitivity of the developed segmentation reached 88% while the value of positive predictivity of segmentation reached 92%. The success rate of chromosome pairing achieves 77%. | en |
| dc.description.mark | A | cs |
| dc.identifier.citation | JAROŠ, L. Obrazová analýza mitotických chromosomů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2017. | cs |
| dc.identifier.other | 102358 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/65455 | |
| dc.language.iso | cs | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | Chromosom | cs |
| dc.subject | lidský karyotyp | cs |
| dc.subject | cytogenetika | cs |
| dc.subject | barvící metody chromosomů | cs |
| dc.subject | předzpracování obrazu | cs |
| dc.subject | analýza obrazu | cs |
| dc.subject | Chromosome | en |
| dc.subject | human karyotype | en |
| dc.subject | cytogenetic | en |
| dc.subject | chromosome staining methods | en |
| dc.subject | image preprocessing | en |
| dc.subject | image analysis | en |
| dc.title | Obrazová analýza mitotických chromosomů | cs |
| dc.title.alternative | Digital image analysis of mitotic chromosomes | en |
| dc.type | Text | cs |
| dc.type.driver | masterThesis | en |
| dc.type.evskp | diplomová práce | cs |
| dcterms.dateAccepted | 2017-06-06 | cs |
| dcterms.modified | 2017-06-08-15:30:19 | cs |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií | cs |
| sync.item.dbid | 102358 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2025.03.26 13:27:39 | en |
| sync.item.modts | 2025.01.15 22:19:22 | en |
| thesis.discipline | Biomedicínské inženýrství a bioinformatika | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrství | cs |
| thesis.level | Inženýrský | cs |
| thesis.name | Ing. | cs |
Files
Original bundle
1 - 3 of 3
Loading...
- Name:
- final-thesis.pdf
- Size:
- 2.85 MB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- final-thesis.pdf
Loading...
- Name:
- review_102358.html
- Size:
- 4.5 KB
- Format:
- Hypertext Markup Language
- Description:
- file review_102358.html