Vyhledávání přesných a přibližných repetic v sekvenci DNA na základě porovnávaní znaků
Loading...
Date
Authors
Martaus, Pavel
Advisor
Referee
Mark
D
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
ORCID
Abstract
V této práci je v teoretické části popsána repetitivní DNA, její typy a metody pro jejich vyhledávání v sekvenci DNA. V praktické části je navržen a popsán algoritmus pro vyhledávání tandemových repetic s využitím Hammingové vzdálenosti, následně jeho zhodnocení a využití.
This work is described in the theoretical part of repetitive DNA, their types and methods to search in DNA sequence. In the practical part is designed and described an algorithm for finding tandem repeats using Hamming, then its evaluation and utilization.
This work is described in the theoretical part of repetitive DNA, their types and methods to search in DNA sequence. In the practical part is designed and described an algorithm for finding tandem repeats using Hamming, then its evaluation and utilization.
Description
Citation
MARTAUS, P. Vyhledávání přesných a přibližných repetic v sekvenci DNA na základě porovnávaní znaků [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2012.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Biomedicínská technika a bioinformatika
Comittee
doc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda)
doc. Ing. Jiří Rozman, CSc. (místopředseda)
Ing. Denisa Maděránková, Ph.D. (člen)
prof. MUDr. Marie Nováková, Ph.D. (člen)
MUDr. Eva Závodná, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2012-08-31
Defence
Student prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky.
Student odpověděl na otázky členů komise:
doc. Kolář: Zlepšení popisu vytvořeného programu.
Ing. Maděránková: Úspěšnost detekce.
MUDr. Závodná: Maximální délka zpracovávaných sekvencí, je omezena? Jaké repetice jsou vyhledávány?
Student obhájil bakalářskou práci.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena