Characterization of Egg Laying Hen and Broiler Fecal Microbiota in Poultry Farms in Croatia, Czech Republic, Hungary and Slovenia

Simple item page
dc.contributor.authorVídeňská, Petracs
dc.contributor.authorRahman, Masudurcs
dc.contributor.authorFaldynová, Marcelacs
dc.contributor.authorBabák, Vladimírcs
dc.contributor.authorMatulová, Martacs
dc.contributor.authorPrukner-Radovcic, Estellacs
dc.contributor.authorKřížek, Ivancs
dc.contributor.authorSmole-Mozina, Sonjacs
dc.contributor.authorKovac, Jasnacs
dc.contributor.authorSzmolka, Amacs
dc.contributor.authorNagy, Belacs
dc.contributor.authorSedlář, Karelcs
dc.contributor.authorČejková, Darinacs
dc.contributor.authorRychlík, Ivancs
dc.coverage.issue10cs
dc.coverage.volume9cs
dc.date.issued2014-10-16cs
dc.description.abstractPoultry meat is the most common protein source of animal origin for humans. However, intensive breeding of animals in confined spaces has led to poultry colonisation by microbiota with a zoonotic potential or encoding antibiotic resistances. In this study we were therefore interested in the prevalence of selected antibiotic resistance genes and microbiota composition in feces of egg laying hens and broilers originating from 4 different Central European countries determined by real-time PCR and 16S rRNA gene pyrosequencing, respectively. strA gene was present in 1 out of 10,000 bacteria. The prevalence of sul1, sul2 and tet(B) in poultry microbiota was approx. 6 times lower than that of the strA gene. tet(A) and cat were the least prevalent being present in around 3 out of 10,000,000 bacteria forming fecal microbiome. The core chicken fecal microbiota was formed by 26 different families. Rather unexpectedly, representatives of Desulfovibrionaceae and Campylobacteraceae, both capable of hydrogen utilisation in complex microbial communities, belonged among core microbiota families. Understanding the roles of individual population members in the total metabolism of the complex community may allow for interventions which might result in the replacement of Campylobacteraceae with Desulfovibrionaceae and a reduction of Campylobacter colonisation in broilers, carcasses, and consequently poultry meat products.en
dc.description.abstractDrůbeží maso je nejčastějším zdrojem bílkovin živočišného původu pro lidi. Nicméně, intenzivní chov zvířat v uzavřených prostorech vedlo k drůbeže kolonizace mikroflóry s původců možných nebo kódující antibiotickou rezistencí. V této studii jsme proto zájem o výskytu vybraných genů rezistence a složení mikroflóry ve výkalech vaječných nosnic a brojlerů pocházejících ze 4 různých zemích střední Evropy stanovených real-time PCR a 16S rRNA genu Pyrosequencing, resp. avohcýv gen byl přítomen v 1 z 10000 bakterií.Prevalence sul1, sul2 a tet (B) v drůbežím mikroflóry je cca. 6 krát nižší než u genu Stra. tet (A) a kočky byly alespoň převládající je přítomen v asi 3 z 10000000 bakterií tvořících fekální mikrobiomem. Jádro kuře fekální mikroflóry byla vytvořena 26 různých rodin. Nečekaně, zástupci Desulfovibrionaceae a Campylobacteraceae, jak dokáže využití vodíku v komplexních mikrobiálních společenstev, patřil mezi klíčové mikroflóry rodiny. Pochopení role jednotlivých členů populace na celkovém metabolismu komplexní komunity mohou povolit zásahy, které by mohly vést k nahrazení Campylobacteraceae s Desulfovibrionaceae a snížení Campylobacter kolonizace u brojlerů, jatečně upravená těla a následně výrobky z drůbežího masa.cs
dc.formattextcs
dc.format.extente110076-e110076cs
dc.format.mimetypeapplication/pdfcs
dc.identifier.citationPLOS ONE. 2014, vol. 9, issue 10, p. e110076-e110076.en
dc.identifier.doi10.1371/journal.pone.0110076cs
dc.identifier.issn1932-6203cs
dc.identifier.orcid0000-0002-8269-4020cs
dc.identifier.orcid0000-0002-6989-6330cs
dc.identifier.other109880cs
dc.identifier.researcheridK-1120-2014cs
dc.identifier.scopus56309904900cs
dc.identifier.scopus23099215700cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/69201
dc.language.isoencs
dc.publisherPublic Library of Sciencecs
dc.relation.ispartofPLOS ONEcs
dc.relation.urihttp://europepmc.org/articles/PMC4199679?pdf=rendercs
dc.rightsCreative Commons Attribution 4.0 Internationalcs
dc.rights.accessopenAccesscs
dc.rights.sherpahttp://www.sherpa.ac.uk/romeo/issn/1932-6203/cs
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/cs
dc.subjectmetagenomicsen
dc.subjectchicken microbiotaen
dc.subject16S rRNAen
dc.subjectmetagenomika
dc.subjectmikroflóra
dc.subject16S rRNA
dc.titleCharacterization of Egg Laying Hen and Broiler Fecal Microbiota in Poultry Farms in Croatia, Czech Republic, Hungary and Sloveniaen
dc.title.alternativeCharakteristika fekální mikroflóry nosnic a brojlerů v drůbežářských velkofarmách v Chorvatsku, České republice, Maďarsku a Slovinskucs
dc.type.driverarticleen
dc.type.statusPeer-revieweden
dc.type.versionpublishedVersionen
sync.item.dbidVAV-109880en
sync.item.dbtypeVAVen
sync.item.insts2025.02.03 15:40:04en
sync.item.modts2025.01.17 16:45:31en
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 1 of 1
Thumbnail Image
Name:
journal.pone.0110076.PDF
Size:
602.32 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
journal.pone.0110076.PDF
Download
Collections
Ústav biomedicínského inženýrství