but.committee	doc. Ing. František Zbořil, CSc. (předseda) prof. Ing. Miroslav Švéda, CSc. (místopředseda) doc. Ing. Michal Bidlo, Ph.D. (člen) prof. RNDr. Milan Češka, CSc. (člen) Prof. RNDr. Mária Lucká, Ph.D. (člen) Mgr. Ing. Pavel Očenášek, Ph.D. (člen)	cs
but.defence	Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm E. Otázky u obhajoby: Špecifikujte databázy súvisiace s väzobnými miestami transkripčných faktorov, s ktorými ste sa stretli počas práce na diplomovej práci. Načrtnite, aké typy rysov/modelov by potenciálne mohli predikciu spresniť.	cs
but.jazyk	čeština (Czech)
but.program	Informační technologie	cs
but.result	práce byla úspěšně obhájena	cs
dc.contributor.advisor	Martínek, Tomáš	cs
dc.contributor.author	Radakovič, Jozef	cs
dc.contributor.referee	Vogel, Ivan	cs
dc.date.created	2015	cs
dc.description.abstract	Proteín p53, ktorý je kódovaný génom TP53 zohráva významnú úlohu v bunečnom cykle, ako regulátor transkripcie génov pri reakcii bunky na stresové podnety, čím funguje ako potláčateľ rakoviny. Pochopenie spôsobu jeho regulácie ako aj jeho väzby na regulovaný gén je jedným z hlavných záujmov moderného výskumu v genetike a bioinformatike. V prvej časti tejto práce predstavujeme nevyhnutné poznatky z molekulárnej biológie nutné k pochopeniu spôsobu regulácie proteínu p53 a úvod do analýzy a predikcie väzobných miest transkripčných faktorov. V druhej časti sa venujeme implementovaniu a testovaniu nami vytvoreného nástroja, ktorý bude schopný tieto väzobné miesta pre proteín p53 predikovať.	cs
dc.description.abstract	Protein p53 which is encoded by gene TP53 plays crucial role in cell cycle as a regulator of transcription of genes in cases when cell is under stress. Therefore p53 acts like tumor suppressor. Understanding the pathway of p53 regulation as well as predicting its binding sites on p53 regulated genes is one of the major concerns of modern research in genetics and bioinformatics. In first part of this project we aim to introduce basics from molecular biology to better understand the p53 protein pathway in gene transcription and introduction to analysis of prediction of p53 binding sites. Second part is about implementation and testing of tool which would be able to predict transcription factor binding sites for protein p53.	en
dc.description.mark	E	cs
dc.identifier.citation	RADAKOVIČ, J. Predikce vazebních míst proteinu p53 [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2015.	cs
dc.identifier.other	88839	cs
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11012/52316
dc.language.iso	cs	cs
dc.publisher	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií	cs
dc.rights	Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení	cs
dc.subject	DNA	cs
dc.subject	proteín p53	cs
dc.subject	transkripčné faktory	cs
dc.subject	Skryté Markovské Modely	cs
dc.subject	HMM	cs
dc.subject	DNA	en
dc.subject	protein p53	en
dc.subject	transcription factors	en
dc.subject	Hidden Markov Models	en
dc.subject	HMM	en
dc.title	Predikce vazebních míst proteinu p53	cs
dc.title.alternative	Prediction of p53 Protein Binding Sites	en
dc.type	Text	cs
dc.type.driver	masterThesis	en
dc.type.evskp	diplomová práce	cs
dcterms.dateAccepted	2015-06-24	cs
dcterms.modified	2020-05-10-16:12:18	cs
eprints.affiliatedInstitution.faculty	Fakulta informačních technologií	cs
sync.item.dbid	88839	en
sync.item.dbtype	ZP	en
sync.item.insts	2025.03.26 15:20:19	en
sync.item.modts	2025.01.17 10:02:30	en
thesis.discipline	Inteligentní systémy	cs
thesis.grantor	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav počítačových systémů	cs
thesis.level	Inženýrský	cs
thesis.name	Ing.	cs

Predikce vazebních míst proteinu p53

Files

Original bundle

Collections