Číslicové zpracování rostlinných genomů

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Jiří Kozumplík, CSc. (předseda) doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (místopředseda) Ing. Helena Vítková, Ph.D. (člen) Mgr. Daniel Vlk, CSc. (člen) MUDr. Kateřina Fialová, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Student obhájil bakalářskou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta. Doc. Kozumplík položil otázku: Na základě čeho byl tvořen referenční znakový strom? Jak byly stanoveny vzdálenosti sekvencí? Ing. Škutková položila otázku: Jakým způsobem byl odstraněn lineární trend? Nedojde zvolenou metodou k odstranění specifické informace z průběhu signálu?cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorSedlář, Karelcs
dc.contributor.authorJugas, Robincs
dc.contributor.refereeVítková, Helenacs
dc.date.created2014cs
dc.description.abstractPráce navazuje na rozvoj v oblasti numerických reprezentací DNA sekvencí v uplynulých letech. Cílem bakalářské práce je zpracovat přehled numerických reprezentací DNA sekvencí a popsat vlastnosti a rozdíly genetického kódu jaderného a mitochondriálního genomu se zaměřením na rostliny. Zakončením je zhodnocení využitelnosti daných signálových reprezentací pro klasifikaci organismů. Teoretická část se zabývá popisem biologických skutečností, přehledem metod konverze DNA sekvence do signálové podoby, metodami klasifikace organismů a algoritmem DTW. Praktická část sestává z vytvoření uživatelské aplikace pro klasifikaci organismů na základě numerických reprezentací a analýza využitelnosti těchto reprezentací pro klasifikaci. Výstupy shlukové analýzy numerických sekvencí jsou srovnány s fylogenetickým stromemcs
dc.description.abstractThis work continues in development of DNA numerical representation’s field in the recent years. The aim of this bachelor thesis is to work out an overview of numerical representations of DNA sequences and to describe the differences and properties of nuclear and mitochondrial genetic code focused on plants. Final objective is analysis of usability these signal’s representations for classification of organisms. The theoretical part is focused on description of biological facts, overview of conversion methods of DNA sequences into signals, the methods of organisms classification and the DTW algorithm. The practical part contain the created GUI application for organism classification based on numerical sequences and the analysis of usability these numerical representations for classification. The outputs of cluster analysis of numerical sequences are compared with the phylogenetic tree.en
dc.description.markBcs
dc.identifier.citationJUGAS, R. Číslicové zpracování rostlinných genomů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2014.cs
dc.identifier.other72824cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/33410
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectbioinformatikacs
dc.subjectmitochondriecs
dc.subjectDNAcs
dc.subjectDNA signálycs
dc.subjectDTWcs
dc.subjectbioinformaticsen
dc.subjectmitochondrionen
dc.subjectDNAen
dc.subjectDNA signalsen
dc.subjectDTWen
dc.titleČíslicové zpracování rostlinných genomůcs
dc.title.alternativeDigital processing of plant genomesen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2014-06-18cs
dcterms.modified2014-06-20-10:10:42cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid72824en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.16 13:30:03en
sync.item.modts2025.01.15 12:53:23en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
3.32 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
69.21 KB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_72824.html
Size:
5.81 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_72824.html
Download
Collections
2014