Možnosti identifikace patogenů pomocí MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie
Loading...
Date
Authors
Fusková, Lucie
ORCID
Advisor
Referee
Mark
C
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická
Abstract
Předložená bakalářská práce se zaměřuje na využití techniky MALDI-TOF MS k identifikaci rostlinných patogenů, konkrétně k identifikaci plísní rodu Fusarium napadajících obiloviny. Plísně představují vážnou hrozbu pro zemědělství a potravinářský průmysl. Stávající metody identifikace jsou časově náročné a často nedokážou poskytnout přesné výsledky. Hmotnostní spektrometrie nabízí rychlou a spolehlivou alternativu. Identifikace pomocí MALDI je charakteristická svou vysokou přesností, citlivostí a rychlostí ve srovnání s běžně používanými metodami. Práce se věnuje optimalizaci metody na kultivovaných kmenech plísní a identifikaci plísní v napadeném obilí. Výsledky práce ukazují potenciál využití techniky MALDI pro identifikaci rostlinných patogenů.
This bachelor thesis focuses on the utilization of MALDI-TOF MS technique for the identification of plant pathogens, specifically targeting molds of the genus Fusarium affecting cereals. Molds pose a serious threat to agriculture and the food industry. Current identification methods are time-consuming and often fail to provide precise results. Mass spectrometry offers a rapid and reliable alternative. Identification via MALDI is characterized by its high accuracy, sensitivity, and speed compared to commonly used methods. The thesis addresses the optimization of the method using cultured fungal strains and the identification of molds in infected cereals. The results of the study demonstrate the potential of utilizing MALDI technique for the identification of plant pathogens.
This bachelor thesis focuses on the utilization of MALDI-TOF MS technique for the identification of plant pathogens, specifically targeting molds of the genus Fusarium affecting cereals. Molds pose a serious threat to agriculture and the food industry. Current identification methods are time-consuming and often fail to provide precise results. Mass spectrometry offers a rapid and reliable alternative. Identification via MALDI is characterized by its high accuracy, sensitivity, and speed compared to commonly used methods. The thesis addresses the optimization of the method using cultured fungal strains and the identification of molds in infected cereals. The results of the study demonstrate the potential of utilizing MALDI technique for the identification of plant pathogens.
Description
Keywords
Biomolekuly, Fusarium, Hmotnostní spektrometrie, Identifikace, Ionizace, MALDI (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization), Plísně, Rostlinné patogeny, Spektrum, Biomolecules, Fusarium, Mass Spectrometry, Identification, Ionization, MALDI (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization), Molds, Plant Pathogens, Spectrum
Citation
FUSKOVÁ, L. Možnosti identifikace patogenů pomocí MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2024.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Biochemická technologie
Comittee
prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (předseda)
doc. Ing. Pavel Diviš, Ph.D. (místopředseda)
prof. Ing. Stanislav Obruča, Ph.D. (člen)
prof. Mgr. Václav Brázda, Ph.D. (člen)
doc. RNDr. Renata Mikulíková, Ph.D. (člen)
doc. Ing. Eva Vítová, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2024-06-12
Defence
1. Studentka seznámila členy komise s náplní a cílem bakalářské práce.
2. Byly přečteny posudky na bakalářskou práci.
3. Studentka akceptovala všechny připomínky oponentky a odpověděla na otázky.
Diskuse:
prof. RNDr. Ivana Márová, CSc.
Co podle Vás nebylo splněné z cílů práce? Identifikovala jste plísně ve vzorcích obilí?
Jakým způsobem byla srovnávána Vámi naměřená data s literaturou?
Existuje databáze spekter? Věděli jste jakou plísní bylo obilí kontaminováno?
Jaký byl záměr pracoviště identifikovat vláknité houby právě pomocí MALDI-TOF?
Je možné identifikovat na základně jednoho píku o jaký druh se jedná?
doc. RNDr. Renata Mikulíková, Ph.D.
Byla vytvářena z Vámi naměřených dat knihovna?
Zaměřovali jste se také na sekundární metabolity? Stanovovali jste mykotoxiny? Víte, jaké mykotoxiny produkují Vámi zkoumané plísně? Proč jsou dané mykotoxiny tak toxické?
Mohou se mykotoxiny z ječmene dostat do piva?
Studentka odpověděla na doplňující otázky členů komise, které byly v průběhu diskuse k dané problematice vzneseny. Studentka prokázala dobré odborné znalosti i schopnost samostatné prezentace dosažených výsledků.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení