Předzpracování obrazu 1D gelové elektroforézy
Loading...
Date
Authors
Hlavatý, Matej
Advisor
Referee
Mark
A
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
ORCID
Abstract
Projekt sa zaoberá automatickým spracovaním výsledkov 1D gélovej elektroforézy. Študuje základné princípy elektroforézy a druhy šumu a chýb ovplyvňujúcich výsledok. Navrhovaný program slúži na automatickú detekciu stĺpcov v obraze. Z čiernobielych digitálnych snímkov elektroforézy vytvára sumačnú projekciu na vodorovnú os. Po vyhladení profilu hľadá lokálne minimá pomocou derivácie projekcie. V týchto miestach určuje hranice medzi stĺpcami dát.
The aim of this project is an automatic analysis of 1D gel electrophoresis results. Basic principles of gel electrophoresis and types of errors and signal noise influencing the result are studied. The proposed algorithm serves for automatic detection of lanes in the image. Summation projection on the horizontal axis is created from black-and-white digital pictures of electrophoresis. Local minima of the profile are located after smoothing the profile. In the location of these minima borders between lanes are established.
The aim of this project is an automatic analysis of 1D gel electrophoresis results. Basic principles of gel electrophoresis and types of errors and signal noise influencing the result are studied. The proposed algorithm serves for automatic detection of lanes in the image. Summation projection on the horizontal axis is created from black-and-white digital pictures of electrophoresis. Local minima of the profile are located after smoothing the profile. In the location of these minima borders between lanes are established.
Description
Citation
HLAVATÝ, M. Předzpracování obrazu 1D gelové elektroforézy [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2014.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Biomedicínská technika a bioinformatika
Comittee
doc. Ing. Jiří Rozman, CSc. (předseda)
Ing. Martin Vítek, Ph.D. (místopředseda)
prof. MUDr. Aleš Hep, CSc. (člen)
Mgr. Martina Raudenská, Ph.D. (člen)
Ing. Jan Odstrčilík, Ph.D. (člen)
doc. Ing. Daniel Schwarz, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2014-06-18
Defence
Student prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Student obhájil bakalářskou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena