Zpracování dat při studiu růstu raných smrkových embryí zobrazovacími MR technikami
Loading...
Date
2008-11-13
Authors
Bartušek, Karel
Gescheidtová, Eva
Kízek, René
Dokoupil, Zdeněk
ORCID
Advisor
Referee
Mark
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
International Society for Science and Engineering, o.s.
Abstract
The technique of MRI (Magnetic Resonance Imaging) can be used to determine the number of hydrogen nuclei in biological tissues or when monitoring the growth of tissue culture. To assess the growth rate, the increase in the content of proton nuclei, and the shape of clusters of early growing somatic embryos, examinations were conducted using the MR techniques [1]. The measurements were part of research aimed at verifying the hypothesis of increased water content during the growth of tissue culture contaminated with cadmium. The culture to be measured was placed in the working space of a tomograph and a suitable direction of the slice plane was chosen, in which the MR image was then measured. The intensity of an image weighted by spin density is proportionate to the number of proton nuclei in the chosen slice, and the MR image is the mapping of their distribution in the cluster of growing tissue culture under examination [2]. The same technique was used to characterize the growth of early spruce embryos contaminated with lead and zinc. In the course of long-term measurements it is not possible to guarantee the stability of MR system and therefore the results were first normalized. The intensity integral was calculated from the MR images, which characterizes the number of protons of the growing cluster. The changes in the integral during the growth were established. The growth of tissue culture was evaluated from the size of clusters in diffusion images, which characterizes the change in the volume of clusters. The techniques for processing the data measured are given in the present paper.
Techniku MRI (Magnetic Resonance Imaging) je možné použít pro stanovení počtu vodíkových jader v biologických tkáních nebo při sledování růstu tkáňových kultur. Pro posouzení rychlosti růstu, zvětšování obsahu protonových jader a tvaru shluků raných rostoucích somatických embryí byla provedena vyšetření pomocí MR technik. Měření byla součástí výzkumu pro ověření hypotézy o zvýšení obsahu vody během růstu tkáňové kultury kontaminované kadmiem. Měřená kultura byla umístěna do pracovního prostoru tomografu, byl zvolen vhodný směr roviny řezu a v ní měřen MR obraz. Intenzita obrazu váhovaného spinovou hustotou je úměrná počtu protonových jader ve zvoleném řezu a MR obraz je mapou jejich rozložení v měřeném shluku rostoucí tkáňové kultury . Popsaná technika byla použita pro charakterizování růstu raných smrkových embryí kontaminovaných olovem a zinkem. V průběhu dlouhodobých měření nelze zajistit stabilitu MR systému, proto byly výsledky nejprve normovány. Z MR obrazů byl vypočítán integrál intenzity charakterizující počet protonů rostoucího shluku a stanoveny jeho změny v průběhu růstu. Růst tkáňových kultur byl vyhodnocen z velikosti shluků v difúzních obrazech, charakterizující změnu objemu shluků. Techniky zpracování naměřených dat jsou uvedeny v tomto příspěvku.
Techniku MRI (Magnetic Resonance Imaging) je možné použít pro stanovení počtu vodíkových jader v biologických tkáních nebo při sledování růstu tkáňových kultur. Pro posouzení rychlosti růstu, zvětšování obsahu protonových jader a tvaru shluků raných rostoucích somatických embryí byla provedena vyšetření pomocí MR technik. Měření byla součástí výzkumu pro ověření hypotézy o zvýšení obsahu vody během růstu tkáňové kultury kontaminované kadmiem. Měřená kultura byla umístěna do pracovního prostoru tomografu, byl zvolen vhodný směr roviny řezu a v ní měřen MR obraz. Intenzita obrazu váhovaného spinovou hustotou je úměrná počtu protonových jader ve zvoleném řezu a MR obraz je mapou jejich rozložení v měřeném shluku rostoucí tkáňové kultury . Popsaná technika byla použita pro charakterizování růstu raných smrkových embryí kontaminovaných olovem a zinkem. V průběhu dlouhodobých měření nelze zajistit stabilitu MR systému, proto byly výsledky nejprve normovány. Z MR obrazů byl vypočítán integrál intenzity charakterizující počet protonů rostoucího shluku a stanoveny jeho změny v průběhu růstu. Růst tkáňových kultur byl vyhodnocen z velikosti shluků v difúzních obrazech, charakterizující změnu objemu shluků. Techniky zpracování naměřených dat jsou uvedeny v tomto příspěvku.
Description
Citation
Document type
Peer-reviewed
Document version
Published version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Comittee
Date of acceptance
Defence
Result of defence
Document licence
(C) 2008 Elektrorevue