Vyhledávání homologních genů pomocí metod zpracování signálů

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Jiří Kozumplík, CSc. (předseda) prof.Ing. Marek Penhaker, Ph.D. (místopředseda) Ing. Helena Škutková, Ph.D. (člen) Ing. Martin Mézl, Ph.D. (člen) MUDr. Zuzana Nováková, Ph.D. (člen) Mgr. Erik Staffa, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Studentka obhájila bakalářskou práci s výhradami a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorMaděránková, Denisacs
dc.contributor.authorKamar, Yanacs
dc.contributor.refereeJugas, Robincs
dc.date.accessioned2019-04-03T22:48:39Z
dc.date.available2019-04-03T22:48:39Z
dc.date.created2017cs
dc.description.abstractPráce obsahuje teoretický úvod do molekulární biologie a genetiky na potřebné úrovní, včetně popisu stavby DNA a homologních genů. Jsou popsané pevné a fyzikálně- chemické typy mapování nukleotidů, metody zpracování digitálních signálů. V prostředí MATLAB byli naprogramované numerické reprezentace genů, jmenovitě: rozbalená a kumulovaná fáze, denzitní vektory. S použitím rozbalené fáze a denzitních vektorů s různou délkou bylo uskutečněno vyhledávání CDS úseku v celém genomu pomocí metrických vzdálenosti (euklidovské a canberrské) a korelace. Dále s použitím metrických vzdálenosti byl vyhledán homologní gen v více či méně podobných bakteriálních genomech. Výsledkem je orientační práh vzdálenosti(euklidovské a canberrské) pro nalezení homologních genů v genomech.cs
dc.description.abstractThesis includes the theoretical introduction to molecular biology and genetics on the necessary level, including a description of the structure of DNA and the homologous gene. Described are fixed and physic-chemical kinds of nucleotide mapping, methods for processing digital signals. Numerical representations of genes that were programmed in MATLAB: unwrapped and accumulated phases, density vectors. Using the unwrapped phase and density vectors with windows of different lengths was performed CDS searching in the entire genome by calculation metric distances (euclidean and canberian) and correlation. Also, using the metric distances, a homologous gene was found in more or less similar bacterial genomes. The result is the approximate threshold of distance (euclidean and canberian) using to find homologous genes in genome.en
dc.description.markEcs
dc.identifier.citationKAMAR, Y. Vyhledávání homologních genů pomocí metod zpracování signálů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2017.cs
dc.identifier.other102316cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/68184
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectDNAcs
dc.subjectRNAcs
dc.subjecthomologní gencs
dc.subjectnumerická reprezentacecs
dc.subjectnumerická mapacs
dc.subjectBLASTcs
dc.subjecteuklidovská vzdálenostcs
dc.subjectcanberrská vzdálenostcs
dc.subjectdigitální zpracování signálůcs
dc.subjectDNAen
dc.subjectRNAen
dc.subjecthomologous geneen
dc.subjectnumerical representationen
dc.subjectnumerical mapen
dc.subjectBLASTen
dc.subjecteuclidean distanceen
dc.subjectcanberian distanceen
dc.subjectdigital signal processingen
dc.titleVyhledávání homologních genů pomocí metod zpracování signálůcs
dc.title.alternativeHomology search using digital signal processing methodsen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2017-06-19cs
dcterms.modified2017-06-20-08:58:17cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid102316en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.12 17:58:47en
sync.item.modts2021.11.12 16:56:45en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
3.47 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
3.78 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_102316.html
Size:
5.7 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_102316.html
Download
Collections
2017