Bioinformatická analýza diferenciální exprese u FaDu buněk
Loading...
Date
Authors
Černá, Eliška
Advisor
Referee
Mark
A
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
ORCID
Abstract
Membránový potenciál ovlivňuje klíčové buněčné procesy, jako je proliferace a apoptóza, a jeho změny jsou spojeny s progresí nádoru. Tato práce se zaměřuje na bioinformatickou analýzu diferenciální exprese genů a jejich isoforem u nádorových buněk FaDu rozdělených podle úrovně membránového potenciálu. Popisuje postup zpracování sekvenačních dat, analýzu exprese a funkční interpretaci výsledků. Zjištění přispívají k lepšímu pochopení molekulárních mechanismů spojených s membránovým potenciálem a mohou podpořit nové přístupy v léčbě rakoviny.
Membrane potential influences key cellular processes such as proliferation and apoptosis, and its changes are associated with tumor progression. This study focuses on the bioinformatic analysis of differential gene and isoform expression in FaDu cancer cells, divided based on their membrane potential levels. It describes the workflow of sequencing data processing, expression analysis, and functional interpretation of results. The findings contribute to a better understanding of molecular mechanisms linked to membrane potential and may support new approaches in cancer treatment.
Membrane potential influences key cellular processes such as proliferation and apoptosis, and its changes are associated with tumor progression. This study focuses on the bioinformatic analysis of differential gene and isoform expression in FaDu cancer cells, divided based on their membrane potential levels. It describes the workflow of sequencing data processing, expression analysis, and functional interpretation of results. The findings contribute to a better understanding of molecular mechanisms linked to membrane potential and may support new approaches in cancer treatment.
Description
Citation
ČERNÁ, E. Bioinformatická analýza diferenciální exprese u FaDu buněk [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2025.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
bez specializace
Comittee
doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D. (předseda)
prof. Ing. Valentýna Provazník, Ph.D. (místopředseda)
Ing. Helena Vítková, Ph.D. (člen)
Ing. Roman Jakubíček, Ph.D. (člen)
Ing. Martin Mézl, Ph.D. (člen)
Ing. Lukáš Smital, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2025-06-16
Defence
Studentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky.
Ing. Jakubíček položil otázku: Jak byl proveden výběr nástrojů pro analýzu dat? Je Váš postup automatizován? Bylo by možné ho automatizovat? Ing. Vítková položila otázku: Proč je důležitý rozdíl v mitochondriálním membránovém potenciálu u FaDu buněk? Doc. Šafránek položil otázku: Bylo by možné pokračovat v analýze dat na základě vytipovaných drah?
Studentka obhájila diplomovou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
