but.committee	doc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda) MUDr. Marie Nováková, Ph.D. (místopředseda) Ing. Denisa Maděránková, Ph.D. (člen) Ing. Oto Janoušek, Ph.D. (člen) Mgr. Daniel Vlk, CSc. (člen) MUDr. Kateřina Fialová, Ph.D. (člen)	cs
but.defence	Studentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Studentka obhájila bakalářskou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.	cs
but.jazyk	čeština (Czech)
but.program	Biomedicínská technika a bioinformatika	cs
but.result	práce byla úspěšně obhájena	cs
dc.contributor.advisor	Labounek, René	cs
dc.contributor.author	Piskořová, Zuzana	cs
dc.contributor.referee	Vojtíšek, Lubomír	cs
dc.date.accessioned	2018-10-21T17:46:25Z
dc.date.available	2018-10-21T17:46:25Z
dc.date.created	2015	cs
dc.description.abstract	Bakalářská práce se zabývá trasováním svazků bílé hmoty v difuzních MRI datech mozku (traktografií). Bílá hmota se vyznačuje specifickým charakterem profilu difuze. Úvodní rešeršní část práce obsahuje výčet existujících metod odhadu 3D profilu anizotropní difuze a popis základního rozdělení trasovacích alrgoritmů. Pro odhad profilu difuze byl vybrán difuzní tensorový model. Na základě DTI bylo vytvořeno vektorové pole nesoucí informaci o směru difuze pro každý voxel. Zadáním startovacího bodu jsme získali úlohu řešitelnou aparátem pro řešení obyčejných diferenciálních rovnic. Pro tuto úlohu byla testována Eulerova a Runge-Kuttova metoda, jako terminační podmínky byly zvoleny nízká hodnota frakční anizotropie a práh pro maximální povolené zakřivení trajektorie. Algoritmus byl testován na matematickém a traktografickém fantomu než bylo přistoupeno k aplikaci na reálná data. Výsledky trasování na fantomech prokázaly správnou funkčnost algoritmu. Dle očekávání se objevila chyba v místech křížení vláken, která souvisí s DTI modelem. Pro řešení problematických vláken zadaných startovacími body u okraje vlákna byl navržen algoritmus frakční anizotropií váhované trilineární interpolace, jehož implementace však nepřinesla zásadní zlepšení. Výsledky trasování na reálných biologických datech přinesly diskutabilnější výsledky. Trasování bylo provedeno na 5 subjektech a 4 anatomicky specifických traktech. Výsledky byly srovnány a vyhodnoceny na základě podobnosti s atlasem traktů bílé hmoty.	cs
dc.description.abstract	The aim of this thesis is to design tracking algorithm which will be able to track white matter bundles in diffusion MRI data, this problem is called tractography. Tractography is feasible because specific profile of diffusion appears in white matter. The introduction to the topic includes summary of methods for estimation of diffusion profile and basic tracking algorithms. In this work diffusion tensor model (DTI) was used for estimation of diffusion profile. Based on the DTI, vector field characterizing direction of diffusion for every voxel was created. Combining vector field with seedpoint, we achieved task solvable by Euler or Runge-Kutta method. Termination criteria were established for maximum curvature of trajectory and minimum value of fractional anisotropy (FA). Algorithm was tested on mathematical and tractographical phantom before it was used on real biological data. The results of tracking on phantoms proved the funcionality of the algorithm. Expected error appeared in areas of crossing fibers, it is related to DTI model limitations. To solve problematic fibers characterized by seedpoint near the border of the fiber, FA-weighted trilinear interpolation was designed. Implementation of this algorithm, however, did not cause better results. The results of tracking on the real data were controversial. Tracking was performed on 5 healthy subjects and 4 anatomicaly specific tracts. The results were compared with tractographic atlas.	en
dc.description.mark	A	cs
dc.identifier.citation	PISKOŘOVÁ, Z. Trasování axonálních svazků v difúzních MRI obrazech mozku [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2015.	cs
dc.identifier.other	84377	cs
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11012/39687
dc.language.iso	cs	cs
dc.publisher	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií	cs
dc.rights	Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení	cs
dc.subject	Difuzní MRI	cs
dc.subject	modely pro odhad anizotropní difuze	cs
dc.subject	traktografie	cs
dc.subject	difuzní tensorový model	cs
dc.subject	metoda Runge-Kutta	cs
dc.subject	Eulerova metoda	cs
dc.subject	deterministický trasovací algoritmus	cs
dc.subject	Diffusion MRI	en
dc.subject	models for estimation of anisotropic diffusion	en
dc.subject	tractography	en
dc.subject	diffusion tensor model	en
dc.subject	Runge-Kutta method	en
dc.subject	Euler method	en
dc.subject	deterministic tracking algorithm	en
dc.title	Trasování axonálních svazků v difúzních MRI obrazech mozku	cs
dc.title.alternative	Tracking of axonal bundles in diffusion MRI brain images	en
dc.type	Text	cs
dc.type.driver	bachelorThesis	en
dc.type.evskp	bakalářská práce	cs
dcterms.dateAccepted	2015-06-18	cs
dcterms.modified	2015-06-18-15:25:35	cs
eprints.affiliatedInstitution.faculty	Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií	cs
sync.item.dbid	84377	en
sync.item.dbtype	ZP	en
sync.item.insts	2021.11.22 21:59:38	en
sync.item.modts	2021.11.22 21:42:42	en
thesis.discipline	Biomedicínská technika a bioinformatika	cs
thesis.grantor	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrství	cs
thesis.level	Bakalářský	cs
thesis.name	Bc.	cs

Trasování axonálních svazků v difúzních MRI obrazech mozku

Files

Original bundle

Collections