Vyhodnocení numerických reprezentací pro detekci překryvů

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Martin Augustynek, Ph.D. (místopředseda) Ing. Denisa Maděránková, Ph.D. (člen) Ing. Jiří Sekora (člen) MUDr. Tibor Stračina, Ph.D. (člen) doc. Mgr. Vladan Bernard, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Studentka obhájila bakalářskou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorJugas, Robincs
dc.contributor.authorPleskačová, Barboracs
dc.contributor.refereeMaděránková, Denisacs
dc.date.accessioned2019-04-04T05:44:56Z
dc.date.available2019-04-04T05:44:56Z
dc.date.created2018cs
dc.description.abstractBakalářská práce je zaměřena na vyhodnocení numerických reprezentaci pro detekci překryvů. Úvodní část se věnuje popisu struktury deoxyribonukleové kyseliny. Dále jsou popsány sekvenační metody a techniky pro sestavení genomu. Další část se zabývá numerickými reprezentacemi, které převádějí sekvence DNA do numerické podoby. Na základě metrik podobnosti je otestováno použití těchto reprezentací pro detekci překryvů mezi čteními DNA. V praktické části práce je navržen a zrealizován algoritmus pro detekci překryvů za využití numerických reprezentací. Algoritmus je následně otestován na datech.cs
dc.description.abstractThe bachelor´s thesis is focused on the evaluation of numerical representations suitability for overlap detection. Introductory part deals with description of deoxyribonucleic acid structure. The next part discribes sequencing methods and genome assembly techniques. Following part deals with numerical representations that convert DNA sequences into numerical form. Based on similarity metrics, the use of these representations is tested for the detection of overlaps between DNA reads. In the practical part of the thesis an algorithm for overlap detection is designed and implemented using numerical representations. The algorithm is then tested on data.en
dc.description.markBcs
dc.identifier.citationPLESKAČOVÁ, B. Vyhodnocení numerických reprezentací pro detekci překryvů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2018.cs
dc.identifier.other110521cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/82379
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectDNAcs
dc.subjectDNA sekvenovánícs
dc.subjectsestavení genomucs
dc.subjectnumerické reprezentacecs
dc.subjectmetriky podobnostics
dc.subjectDNAen
dc.subjectDNA sequencingen
dc.subjectgenome assemblyen
dc.subjectnumeric representationen
dc.subjectsimilarity metricsen
dc.titleVyhodnocení numerických reprezentací pro detekci překryvůcs
dc.title.alternativeEvaluation of numerical representations suitability for overlap detectionen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2018-06-14cs
dcterms.modified2018-06-18-07:32:04cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid110521en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.12 11:00:12en
sync.item.modts2021.11.12 10:05:03en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
3.51 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
4.82 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_110521.html
Size:
5.79 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_110521.html
Download
Collections
2018