Webový server pro predikci 3D struktury proteinu

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda) prof. RNDr. Milan Češka, CSc. (místopředseda) Ing. Vladimír Bartík, Ph.D. (člen) prof. RNDr. Mojmír Křetínský, CSc. (člen) doc. Ing. Tomáš Martínek, Ph.D. (člen) doc. Ing. František Zbořil, CSc. (člen)cs
but.defenceStudent nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se pak seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm C. Otázky u obhajoby: V práci uvádíte, že při testování serveru jste dosáhl přesnosti výsledků kolem osmdesáti bodů ze sta. Jak jste tuto přesnost počítal?cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programInformační technologiecs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorBurgetová, Ivanacs
dc.contributor.authorVotroubek, Lukášcs
dc.contributor.refereeOčenášek, Pavelcs
dc.date.created2013cs
dc.description.abstractTato práce se zabývá proteiny, především jejich strukturou a způsoby predikce terciární, neboli 3D, struktury. Predikce terciární struktury je důležitá pro zjištění funkce těchto životně důležitých látek. Využití metod bioinformatiky velice zefektivňuje a zrychluje predikci, protože klasické metody přímého zjišťování struktury z molekuly jsou drahé a pomalé. Na druhou stranu jsou zatím mnohem přesnější. Cílem práce je přiblížit metody používané pro predikci terciární struktury, popsat nástroje, které se používají a možnosti automatické komunikace s nimi. Dále je cílem popsat implementaci serveru, který bude sloužit proteinovým inženýrům pro efektivnější zjišťování informací o terciární struktuře z více nástrojů, aniž by museli zadávat požadavek na každý zvlášť. Také zde budou popsány výsledky testování.cs
dc.description.abstractThis work deals with proteins, especially with their structure and kinds of tertiary, or 3D, structure prediction. Tertiary structure prediction is very important for function prediction of this vitally important substance. Bioinformatics do this prediction much more effective and faster, because classical methods of structure prediction directly from molecule are very expensive and slow. On the other hand they are much more exact. Objective of this thesis is to describe tertiary structure prediction methods, describe used tools and possibility of automatic communication with them.  Next objective is describe implementation of server, that will serve to protein engineers for more effective finding of information about tertiary structure from more servers without requesting each of them separately. Results of testing will be described in this work too.en
dc.description.markCcs
dc.identifier.citationVOTROUBEK, L. Webový server pro predikci 3D struktury proteinu [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2013.cs
dc.identifier.other78803cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/53468
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subject3D strukturacs
dc.subjectterciární strukturacs
dc.subjectpredikcecs
dc.subjecthomologní modelovánícs
dc.subjectthreadingcs
dc.subjectab initiocs
dc.subjectde novocs
dc.subjectSwiss modelcs
dc.subjectCPH-modelscs
dc.subjectESyPred3Dcs
dc.subjectGeno3Dcs
dc.subjectAS2TScs
dc.subject3D-Jigsawcs
dc.subjectPhyre2cs
dc.subjectFuguecs
dc.subjectHHPredcs
dc.subjectLOOPPcs
dc.subjectSAM-T08cs
dc.subjectPSI-PREDcs
dc.subjectI-TASSERcs
dc.subjectRaptorXcs
dc.subjectRobettacs
dc.subjectiPBAcs
dc.subjectSuperfammilycs
dc.subjectJSPcs
dc.subjectJAVAcs
dc.subject3D structureen
dc.subjecttertiary structureen
dc.subjectpredictionen
dc.subjecthomology modelingen
dc.subjectthreadingen
dc.subjectab initioen
dc.subjectde novoen
dc.subjectSwiss modelen
dc.subjectCPH-modelsen
dc.subjectESyPred3Den
dc.subjectGeno3Den
dc.subjectAS2TSen
dc.subject3D-Jigsawen
dc.subjectPhyre2en
dc.subjectFugueen
dc.subjectHHPreden
dc.subjectLOOPPen
dc.subjectSAM-T08en
dc.subjectPSI-PREDen
dc.subjectI-TASSERen
dc.subjectRaptorXen
dc.subjectRobettaen
dc.subjectiPBAen
dc.subjectSuperfammilyen
dc.subjectJSPen
dc.subjectJAVAen
dc.titleWebový server pro predikci 3D struktury proteinucs
dc.title.alternativeWeb Server for Protein Structure Predictionen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2013-06-20cs
dcterms.modified2020-05-09-23:43:10cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta informačních technologiícs
sync.item.dbid78803en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.26 15:15:07en
sync.item.modts2025.01.16 00:16:47en
thesis.disciplineBioinformatika a biocomputingcs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav informačních systémůcs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 2 of 2
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
2 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
review_78803.html
Size:
1.45 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_78803.html
Download
Collections
2013