Číslicové zpracování mitochondriálních genomů

but.committeeprof. Ing. Valentýna Provazník, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (místopředseda) Ing. Milan Blaha, Ph.D. (člen) doc. MUDr. Zdeněk Wilhelm, CSc. (člen) MUDr. Lenka Forýtková, CSc. (člen)cs
but.defenceStudent prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Student obhájil bakalářskou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorVítková, Helenacs
dc.contributor.authorSonnenschein, Jiřícs
dc.contributor.refereeVítek, Martincs
dc.date.created2012cs
dc.description.abstractCílem této bakalářské práce je vyzkoušet nový a výpočetně méně náročný způsob klasifikace mitochondriálních sekvencí, při kterém je využito převodu symbolické sekvence do numerického zápisu. Úvodní část je věnována popisu nukleových kyselin a mitochondrií. Navazující část se zaměřuje na možnosti numerického vyjádření zápisu biologických sekvencí beze ztráty původní biologické informace. Jsou popsány možnosti fázové a frekvenční analýzy genomických signálů. Je uveden princip shlukové analýzy a metody konstrukce dendrogramu. V praktické části je provedena analýza mitochondriálních genomů, u kterých je vypočtena jejich rozbalená a kumulovaná fáze. Pomocí shlukové analýzy jsou porovnány mitochondriální sekvence a sestrojen dendrogram.cs
dc.description.abstractThe aim of this thesis is to test new less hardware demanding method of mitochondrial genom classification, for which numerical representation of biological sequences is used. Introductory part is focused on description of nucleic acids and mitochondrion. In following part of thesis, types of numerical representation of biological sequences without losing the original biological information are described. There are introduced possibilities of phase and frequency-domain analysis and principles of cluster analysis and dendrogram construction methods. Practical part of this work deals with analysis of mitochondrial genome for which cumulated and unwrapped phases are calculated. Mitochondrial sequences are compared by cluster analysis and dendrogram is constructed.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationSONNENSCHEIN, J. Číslicové zpracování mitochondriálních genomů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2012.cs
dc.identifier.other51769cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/12408
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectMitochondriecs
dc.subjectgenomcs
dc.subjectčíslicové zpracovánícs
dc.subjectanalýza DNA sekvencícs
dc.subjectshluková analýzacs
dc.subjectdendrogram.cs
dc.subjectMitochondrionen
dc.subjectgenomeen
dc.subjectnumerical representationen
dc.subjectanalysis of DNA sequencesen
dc.subjectcluster analysisen
dc.subjectdendrogram.en
dc.titleČíslicové zpracování mitochondriálních genomůcs
dc.title.alternativeDigital signal processing of mitochondrial genomesen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2012-06-14cs
dcterms.modified2012-06-18-09:24:46cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid51769en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.16 13:21:48en
sync.item.modts2025.01.15 23:51:57en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
1.73 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
1.24 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Loading...
Thumbnail Image
Name:
review_51769.html
Size:
4.56 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_51769.html
Collections