Identifikace variability v celogenomových sestaveních

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Daniel Novák, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (místopředseda) Ing. Andrea Němcová, Ph.D. (člen) Ing. Helena Škutková, Ph.D. (člen) MUDr. Michal Jurajda, Ph.D. (člen) Ing. Martin Králík (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Škutková se zeptala na otázky oponenta. Jaké bylo pokrytí v poolech. Jaké byly zvoleny referenční sekvence pro mapování genomů. Pro každý gen byl jiný referenční genom? Byla použita konsensuální sekvence? Byly sekvence kompletní? Z jaké části databáze byly data použity? Ing. Němcová se zeptala, jak se stanoví referenční sekvence. Jaké jsou možnosti vytvoření konsensuální sekvence. Studentka neobhájila bakalářskou práci. Komise doporučuje přepracovat práci dle připomínek v obou posudcích.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce nebyla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorBartoň, Vojtěchcs
dc.contributor.authorMorávková, Dalenacs
dc.contributor.refereeŠkutková, Helenacs
dc.date.accessioned2022-06-16T06:52:11Z
dc.date.available2022-06-16T06:52:11Z
dc.date.created2022cs
dc.description.abstractTato bakalářská práce se zabývá vyhledáváním variabilit v genomu organismu Treponema pallidum. V teoretické části jsou popsány významné sekvenační technologie, metody mapování genomu a variability genomu. Praktickou část tvoří mapování dat ze sekvenátoru Illumina, jejich zpracování a vyhledávání variabilních pozic.cs
dc.description.abstractThis bachelor thesis deals with searching variable positions in the Treponema Pallidum genome. The theoretical part describes sequencing technologies, methods of genome assembly and variability of genome. The practical part includes processing data sequenced by Illumina sequencing technology and identification of variability in them.en
dc.description.markFcs
dc.identifier.citationMORÁVKOVÁ, D. Identifikace variability v celogenomových sestaveních [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2022.cs
dc.identifier.other142074cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/205743
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectsekvenační technologiecs
dc.subjectNGScs
dc.subjectmapování genomucs
dc.subjectIlluminacs
dc.subjectBowtie2cs
dc.subjectgenetická variabilitacs
dc.subjectTreponema pallidumcs
dc.subjectsequencing technologyen
dc.subjectNGSen
dc.subjectgenome assemblyen
dc.subjectIlluminaen
dc.subjectBowtie2en
dc.subjectgenetic variabilityen
dc.subjectTreponema pallidumen
dc.titleIdentifikace variability v celogenomových sestaveníchcs
dc.title.alternativeVariability identification in whole-genome assembliesen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2022-06-15cs
dcterms.modified2022-06-15-13:00:21cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid142074en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2022.06.16 08:52:10en
sync.item.modts2022.06.16 08:19:15en
thesis.disciplinebez specializacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
4.57 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
3.79 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_142074.html
Size:
7.5 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_142074.html
Download
Collections
2022